RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 APCP25054 2843 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GUH1 482 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 POM121BA6NF01 834 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CES2O00748 559 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CPNE6O95741 557 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 IDEP14735 1019 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TSHRP16473 764 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CCL11P51671 97 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 STK4Q13043 487 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CDH18Q13634 790 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 AMZ1Q400G9 498 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 HPS6Q86YV9 775 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CARNMT1Q8N4J0 409 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 RAD54LQ92698 747 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ZBTB9Q96C00 473 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 C19orf60Q96EN9 201 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 FEM1CQ96JP0 617 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TBATAQ96M53 351 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 SLC17A9Q9BYT1 436 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 PARVGQ9HBI0 331 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 MED4Q9NPJ6 270 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 APPL1Q9UKG1 709 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 PILRAQ9UKJ1 303 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 BSNQ9UPA5 3926 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 TARM1B6A8C7 271 aa6.15□□□□□ -1.42
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PTPRK-211ENST00000429595 GFPT2O94808 682 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 FAM200BP0CF97 657 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CPEP16870 476 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 HTR1EP28566 365 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 DLSTP36957 453 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 KIF5AQ12840 1032 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TRPC3Q13507 836 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TUBB3Q13509 450 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 RAB39AQ14964 217 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 SPA17Q15506 151 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CHRNA6Q15825 494 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ETFDHQ16134 617 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 MPP7Q5T2T1 576 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CEACAM20Q6UY09 585 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 SLC35F6Q8N357 371 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ESX1Q8N693 406 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 FIBINQ8TAL6 211 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 SLC2A14Q8TDB8 520 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 RNF139Q8WU17 664 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 HDAC10Q969S8 669 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 SAAL1Q96ER3 474 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC42Q96M95 316 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 CHP1Q99653 195 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 TSG101Q99816 390 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRK-211ENST00000429595 SMOQ99835 787 aa6.15□□□□□ -1.42
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