RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 ERVK-10P10266 1014 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 CYP11B2P19099 503 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 CAMK2DQ13557 499 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 PTPRCAPQ14761 206 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 KIAA1644Q3SXP7 199 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 C1orf141Q5JVX7 400 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 KRT39Q6A163 491 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 SH2D5Q6ZV89 423 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 NUP54Q7Z3B4 507 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 CDK20Q8IZL9 346 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 XXYLT1Q8NBI6 393 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 KBTBD8Q8NFY9 601 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 OR11H4Q8NGC9 324 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 DHX58Q96C10 678 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 HDAC11Q96DB2 347 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 ARSGQ96EG1 525 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 RADILQ96JH8 1075 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 NUP85Q9BW27 656 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 LAT2Q9GZY6 243 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 OR10A4Q9H209 315 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 GKN1Q9NS71 199 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 CACNG4Q9UBN1 327 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 KCNJ14Q9UNX9 436 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 C2CD2Q9Y426 696 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa3.87□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 A0A1W2PPQ1 181 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 NEMP2A6NFY4 417 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 ZNF197O14709 1029 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 APOA4P06727 396 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 OR52Z1P0C646 297 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 PATE4P0C8F1 98 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 PRSS56P0CW18 603 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 CA4P22748 312 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 CHRNB4P30926 498 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 MAP2K2P36507 400 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 MNDAP41218 407 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 RAB28P51157 221 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 TUBB4BP68371 445 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 RBPJQ06330 500 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 UGP2Q16851 508 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 TCP11X2Q5H9J9 407 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 KRBOX4Q5JUW0 171 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 CST9LP1Q5W188 147 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 DET1Q7L5Y6 550 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 ATL1Q8WXF7 558 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 CFAP57Q96MR6 1250 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 TMED3Q9Y3Q3 217 aa3.86□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 A0A1W2PN81 502 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD61A6NGH8 418 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 A8MXE2 369 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 PTGESO14684 152 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 C22orf31O95567 290 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 ACSL3O95573 720 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 PLGP00747 810 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 IGHV2-70P01814 119 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 CFC1BP0CG36 223 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 CFC1P0CG37 223 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 ACHEP22303 614 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 ITGA3P26006 1051 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 HOXC8P31273 242 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 CHRNA7P36544 502 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 PRKCZQ05513 592 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 ACSM1Q08AH1 577 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 HYAL1Q12794 435 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 GPR17Q13304 367 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 TNIP1Q15025 636 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 TAF13Q15543 124 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 CA9Q16790 459 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 ZNF876PQ49A33 203 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 GTDC1Q4AE62 458 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 SPDYCQ5MJ68 293 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 CYP4A22Q5TCH4 519 aa3.85□□□□□ -1.79
RBM39-211ENST00000426951 ARHGEF16Q5VV41 709 aa3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms