RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 NADSYN1Q6IA69 706 aa17.95■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 OR7D4Q8NG98 312 aa17.95■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 LGALS12Q96DT0 336 aa17.95■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 AASSQ9UDR5 926 aa17.95■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 OSGIN1Q9UJX0 560 aa17.95■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 TPRKBQ9Y3C4 175 aa17.95■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 ISPDA4D126 451 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 CXCR6O00574 342 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 MITFO75030 526 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 GGT5P36269 586 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 TGFBR1P36897 503 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 ST13P50502 369 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP4F3Q08477 520 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 RFX4Q33E94 735 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAF7Q6Q0C0 670 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXO44Q9H4M3 255 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 ZMYM5Q9UJ78 669 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 U3KQV3 271 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 E5RI56 91 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 OR7A17O14581 309 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 SNPHO15079 494 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 RFPL2O75678 378 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNK2O95069 426 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 MT-ND2P03891 347 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 TYMPP19971 482 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 MC4RP32245 332 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 NR4A2P43354 598 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 RPL38P63173 70 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA0040Q15053 153 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM26DQ5JW98 314 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 PLD3Q8IV08 490 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 CAPSLQ8WWF8 208 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC13A3Q8WWT9 602 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 GREB1Q4ZG55 1949 aa17.94■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 ELOVL7A1L3X0 281 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 C2orf81A6NN90 581 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 SCELO95171 688 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 PRLP01236 227 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 PIK3CGP48736 1102 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 PON2Q15165 354 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 GALNT5Q7Z7M9 940 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 SVOPQ8N4V2 548 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 ATAD1Q8NBU5 361 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 SETD9Q8NE22 299 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 LPCAT1Q8NF37 534 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 MCFD2Q8NI22 146 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 GTF2H4Q92759 462 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 MGME1Q9BQP7 344 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKHQ9HCJ1 492 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 FADS2O95864 444 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 INHAP05111 366 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC2A4P14672 509 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 MSH3P20585 1137 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 BMPR1AP36894 532 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 LHX8Q68G74 356 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 ALG1LQ6GMV1 187 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 HIPK1Q86Z02 1210 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 MSRB3Q8IXL7 192 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 OR52E4Q8NGH9 312 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 LINC01599Q8WXQ3 324 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXO32Q969P5 355 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 SPON2Q9BUD6 331 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 TESMINQ9Y4I5 508 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa17.93■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 PLXNA3P51805 1871 aa17.92■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 ASNA1O43681 348 aa17.92■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF181Q2M3W8 571 aa17.92■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 GTDC1Q4AE62 458 aa17.92■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF280BQ86YH2 543 aa17.92■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 PHACTR4Q8IZ21 702 aa17.92■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 CHPFQ8IZ52 775 aa17.92■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 CLIP4Q8N3C7 705 aa17.92■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 EFHBQ8N7U6 833 aa17.92■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 ACOT13Q9NPJ3 140 aa17.92■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
RALGPS1-208ENST00000424082 SCN3BQ9NY72 215 aa17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms