RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 SGK494Q96LW2 274 aa2.9□□□□□ -1.94
CCDC82-202ENST00000423339 C17orf77Q96MU5 243 aa2.9□□□□□ -1.94
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF558Q96NG5 402 aa2.9□□□□□ -1.94
CCDC82-202ENST00000423339 PKP4Q99569 1192 aa2.9□□□□□ -1.94
CCDC82-202ENST00000423339 CPNE1Q99829 537 aa2.9□□□□□ -1.94
CCDC82-202ENST00000423339 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.94
CCDC82-202ENST00000423339 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.94
CCDC82-202ENST00000423339 VN1R1Q9GZP7 353 aa2.9□□□□□ -1.94
CCDC82-202ENST00000423339 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.94
CCDC82-202ENST00000423339 MRGBPQ9NV56 204 aa2.9□□□□□ -1.94
CCDC82-202ENST00000423339 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.94
CCDC82-202ENST00000423339 LRWD1Q9UFC0 647 aa2.9□□□□□ -1.94
CCDC82-202ENST00000423339 UACAQ9BZF9 1416 aa2.9□□□□□ -1.94
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1W2PPI3 338 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 MEIS2O14770 477 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 CLIC2O15247 247 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 IGHV4-39P01824 125 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 KRT19P08727 400 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 CYP11B2P19099 503 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 CBLP22681 906 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 MPZP25189 248 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 HOXC13P31276 330 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 PSMC4P43686 418 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 LHX1P48742 406 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 NAGLUP54802 743 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 KIR2DS3Q14952 304 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF718Q3SXZ3 478 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 ASPRV1Q53RT3 343 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 MFSD12Q6NUT3 480 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 TMPRSS11BQ86T26 416 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 COMMD2Q86X83 199 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 SLC4A11Q8NBS3 891 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 RNF128Q8TEB7 428 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 DHX58Q96C10 678 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 Q9N2K0 584 aa2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 ABCC10Q5T3U5 1492 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 TRAV34A0A0B4J273 112 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 HTR3EA5X5Y0 456 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 H0Y626 953 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 PSMD14O00487 310 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 BUB3O43684 328 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 CTSVO60911 334 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 IGKV3-20P01619 116 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 IGHV2-70P01814 119 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 CSN3P07498 182 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 SAGP10523 405 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 CKMT2P17540 419 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 CD22P20273 847 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 PTPN3P26045 913 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 BMXP51813 675 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 CAPZA1P52907 286 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 SCN1BQ07699 218 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 MZT1Q08AG7 82 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 TUBB2AQ13885 445 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 STXBP5Q5T5C0 1151 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 TLK2Q86UE8 772 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 NUDT13Q86X67 352 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 FAM114A1Q8IWE2 563 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 CRYBG2Q8N1P7 616 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF611Q8N823 705 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 TRIML1Q8N9V2 468 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 POC1AQ8NBT0 407 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 FGFBP3Q8TAT2 258 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC107Q8WV48 283 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 SECTM1Q8WVN6 248 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 SSMEM1Q8WWF3 244 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 DNASE2BQ8WZ79 361 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 SCRN2Q96FV2 425 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 FERMT1Q9BQL6 677 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 TUBB2BQ9BVA1 445 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 FZD8Q9H461 694 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 EVA1AQ9H8M9 152 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 TCF7L2Q9NQB0 619 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 ABCF3Q9NUQ8 709 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 DONSONQ9NYP3 566 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 B3GAT1Q9P2W7 334 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 RASAL2Q9UJF2 1139 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 SNX7Q9UNH6 387 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 ARID2Q68CP9 1835 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC82-202ENST00000423339 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms