RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM114B3SHH9 223 aa16.46■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 B4DGG1 531 aa16.46■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAPBPO15533 448 aa16.46■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPHS1O60500 1241 aa16.46■□□□□ 0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RETP07949 1114 aa16.46■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC19A1P41440 591 aa16.46■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCF15Q12870 199 aa16.46■□□□□ 0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PLA2G2CQ5R387 149 aa16.46■□□□□ 0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKS6Q68DC2 871 aa16.46■□□□□ 0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM79Q9BSE2 394 aa16.46■□□□□ 0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNH6Q9H252 994 aa16.46■□□□□ 0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 STK16O75716 305 aa16.45■□□□□ 0.22
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC6A12P48065 614 aa16.45■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIK3CGP48736 1102 aa16.45■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 AGTR2P50052 363 aa16.45■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCT8P50990 548 aa16.45■□□□□ 0.22
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CYP2A13Q16696 494 aa16.45■□□□□ 0.22
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TOP3BP1-201ENST00000420768 OR52E1Q8NGJ3 308 aa16.45■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAPK15Q8TD08 544 aa16.45■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC37A2Q8TED4 501 aa16.45■□□□□ 0.22
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CCND1P24385 295 aa16.44■□□□□ 0.22
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TOP3BP1-201ENST00000420768 HSPA7P48741 367 aa16.44■□□□□ 0.22
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PNLIPRP1P54315 467 aa16.44■□□□□ 0.22
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RCN2Q14257 317 aa16.44■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB133Q30KQ1 61 aa16.44■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTCHD3Q3KNS1 767 aa16.44■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 UNC50Q53HI1 259 aa16.44■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa16.44■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 FRMD7Q6ZUT3 714 aa16.44■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa16.44■□□□□ 0.22
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TOP3BP1-201ENST00000420768 OR56A3Q8NH54 315 aa16.44■□□□□ 0.22
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MENTQ9BUN1 341 aa16.44■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 GSTO2Q9H4Y5 243 aa16.44■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC32A1Q9H598 525 aa16.44■□□□□ 0.22
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TOP3BP1-201ENST00000420768 NLGN3Q9NZ94 848 aa16.44■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCTPQ9UKL6 214 aa16.44■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 DOCK9Q9BZ29 2069 aa16.43■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT87PA6NCN2 255 aa16.43■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 E7ENX8 843 aa16.43■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOBOXO60393 691 aa16.43■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNNO75324 88 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 MLYCDO95822 493 aa16.43■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 LSP1P33241 339 aa16.43■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 SHMT2P34897 504 aa16.43■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC1A6P48664 564 aa16.43■□□□□ 0.22
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