RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 USP24Q9UPU5 2620 aa20.2■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 OR5K3A6NET4 321 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 A8MU76 341 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 AGRPO00253 132 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 TAF4O00268 1085 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 RRP8O43159 456 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 KDM1AO60341 852 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 KRT37O76014 449 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 SLCO2B1O94956 709 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 RPN2P04844 631 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ITIH1P19827 911 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ATP5DP30049 168 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 TAS2R39P59534 338 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 BMPR2Q13873 1038 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 MROH9Q5TGP6 573 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM164Q5U3C3 297 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ADGRD1Q6QNK2 874 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 PRSS42Q7Z5A4 293 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 FAM129CQ86XR2 697 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 LCN9Q8WX39 176 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 CD180Q99467 661 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 SLC30A3Q99726 388 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 POPDC3Q9HBV1 291 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 PLAAQ9Y263 795 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 EPG5Q9HCE0 2579 aa20.19■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 MATN2O00339 956 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 RASSF9O75901 435 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 UQCRHP07919 91 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 CBSLP0DN79 551 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 STMN1P16949 149 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ACADLP28330 430 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 GCAP28676 217 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 CBSP35520 551 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 RGS4P49798 205 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 MAPK10P53779 464 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 PRKAA1Q13131 559 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 GBX1Q14549 363 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 TBC1D21Q8IYX1 336 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF248Q8NDW4 579 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 OR2W6PQ8NHA6 318 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 B3GNT4Q9C0J1 378 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 SRMSQ9H3Y6 488 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 POLG2Q9UHN1 485 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 CDYLQ9Y232 598 aa20.18■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 SMIM23A6NLE4 172 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 B4E171 279 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 NVLO15381 856 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 TSPAN7P41732 249 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 SLCO1A2P46721 670 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 SERPINB8P50452 374 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 RAB15P59190 212 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 RAB10P61026 200 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 PAQR3Q6TCH7 311 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 UNC5DQ6UXZ4 953 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 TDRPQ86YL5 185 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 VRK3Q8IV63 474 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 OR5K2Q8NHB8 316 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 MTBPQ96DY7 904 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 DCBLD2Q96PD2 775 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 SYTL2Q9HCH5 934 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 GPAMQ9HCL2 828 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 HRASLS2Q9NWW9 162 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ASPMQ8IZT6 3477 aa20.17■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 OR6C74A6NCV1 312 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 TLCD2A6NGC4 264 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 EFCAB7A8K855 629 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 TRIM49D1C9J1S8 452 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 RASGRF2O14827 1237 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 CDH16O75309 829 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 CCL4P13236 92 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 CRABP2P29373 138 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 SLC5A2P31639 672 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 SHMT2P34897 504 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ETV5P41161 510 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF460Q14592 562 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms