RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 FRG2Q64ET8 278 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 COX18Q8N8Q8 333 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 PYCR2Q96C36 320 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 C1orf74Q96LT6 269 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 FRG2BQ96QU4 278 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM92AA1XBS5 289 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 PSMD11O00231 422 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 GADD45GO95257 159 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 RYKP34925 604 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 MASP1P48740 699 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 NODALQ96S42 347 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM138Q9NPI0 162 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 MPIP34949 423 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 EIPR1Q53HC9 387 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 CNPPD1Q9BV87 410 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 CLDN7O95471 211 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 IL7RP16871 459 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC7A1P30825 629 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 PIK3CBP42338 1070 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM198Q66K66 360 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 POMZP3Q6PJE2 187 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 AHSA2Q719I0 299 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 SIGLEC10Q96LC7 697 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 KLHL31Q9H511 634 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 AKTIPQ9H8T0 292 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 COPS7AQ9UBW8 275 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 TRMUO75648 421 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 LIN52Q52LA3 116 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 SPIN4Q56A73 249 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 C22orf39Q6P5X5 142 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 OR5K1Q8NHB7 308 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 TLR9Q9NR96 1032 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 CKLFQ9UBR5 152 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 LCHNA4D1U4 455 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 ITM2AO43736 263 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 EDNRBP24530 442 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 STC1P52823 247 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC13A2Q13183 592 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 ENPP7Q6UWV6 458 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 SERINC5Q86VE9 423 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 SMPDL3AQ92484 453 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 TSGA13Q96PP4 275 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 PEBP4Q96S96 227 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 TAPBPLQ9BX59 468 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 GALPQ9UBC7 116 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC30A4O14863 429 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF623O75123 536 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 FGF18O76093 207 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 ETS2P15036 469 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 HMGCS1Q01581 520 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 PCDH1Q08174 1060 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 MSS51Q4VC12 460 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 PITRM1Q5JRX3 1037 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 C7orf43Q8WVR3 580 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 DERL2Q9GZP9 239 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 SCAMP1O15126 338 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 SSNA1O43805 119 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 HCN1O60741 890 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 YAP1P46937 504 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 UBXN2BQ14CS0 331 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC25A24Q6NUK1 477 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 PRR23BQ6ZRT6 265 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 LRRC17Q8N6Y2 441 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 RGMAQ96B86 450 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 CAMK1GQ96NX5 476 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 CDK15Q96Q40 435 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 RETREG1Q9H6L5 497 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 DNAJB4Q9UDY4 337 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 PDE10AQ9Y233 779 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 ANXA8P13928 327 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 TIE1P35590 1138 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 RAB30Q15771 203 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 OXR1Q8N573 874 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 TSTD1Q8NFU3 115 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 LRRC15Q8TF66 581 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 COQ7Q99807 217 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 TP73O15350 636 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 CNTN5O94779 1100 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 TGFBR2P37173 567 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 ARFIP1P53367 373 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 KLHL24Q6TFL4 600 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 SNX33Q8WV41 574 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 GAL3ST4Q96RP7 486 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-203ENST00000409212 ANKHQ9HCJ1 492 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms