RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 DCAF10Q5QP82 559 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 SPESP1Q6UW49 350 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 C4orf22Q6V702 233 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 LINC00523Q86TU6 105 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 SLC35F6Q8N357 371 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 PROKR1Q8TCW9 393 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 C19orf60Q96EN9 201 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 TCTN2Q96GX1 697 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 PBKQ96KB5 322 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 C5orf34Q96MH7 638 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 OR52A5Q9H2C5 316 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 FAM96AQ9H5X1 160 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ETNK1Q9HBU6 452 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 HOMER3Q9NSC5 361 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ASF1BQ9NVP2 202 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ACTR10Q9NZ32 417 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 PAK5Q9P286 719 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 NDOR1Q9UHB4 597 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 SRPK3Q9UPE1 567 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ZNF148Q9UQR1 794 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ANKUB1A6NFN9 424 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 USP27XA6NNY8 438 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 CEP104O60308 925 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 LDLRP01130 860 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 GSTM1P09488 218 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ETS1P14921 441 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 SHMT2P34897 504 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 RPL22P35268 128 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 DCTP40126 519 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 TMPRSS15P98073 1019 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 GSTM4Q03013 218 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ACVR1Q04771 509 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 PRKG2Q13237 762 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 SNX1Q13596 522 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 CYP2A13Q16696 494 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 MLIPQ5VWP3 458 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ZNF787Q6DD87 383 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 IGFL3Q6UXB1 125 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 GALNT16Q8N428 558 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ZADH2Q8N4Q0 377 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 PHC3Q8NDX5 983 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 OR13C4Q8NGS5 318 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ACTRT1Q8TDG2 376 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 RANBP9Q96S59 729 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 AP1M1Q9BXS5 423 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 XKR8Q9H6D3 395 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 TXLNGQ9NUQ3 528 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 IRAK4Q9NWZ3 460 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 RIMKLBQ9ULI2 386 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 NEU2Q9Y3R4 380 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 SEC16AO15027 2179 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 WIPF3A6NGB9 483 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 CBX6O95503 412 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 CLDN1O95832 211 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 UGT2B7P16662 529 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ACRV1P26436 265 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 PDHA2P29803 388 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 MC4RP32245 332 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 MAGEA6P43360 314 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 DCDP81605 110 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 CDH17Q12864 832 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 C1orf189Q5VU69 101 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 RHBDD2Q6NTF9 364 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 TTC27Q6P3X3 843 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 TAS2R42Q7RTR8 314 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 PRUNE1Q86TP1 453 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 TRIM73Q86UV7 250 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 OR2Y1Q8NGV0 311 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 P4HTMQ9NXG6 502 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 SNX12Q9UMY4 172 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ICKQ9UPZ9 632 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 CCL22O00626 93 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 KIF5CO60282 957 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 KDM1AO60341 852 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 IFNB1P01574 187 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 CBSLP0DN79 551 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-204ENST00000403441 COL8A1P27658 744 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.5 ms