RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391058.1

RNU6-1177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC12A3P55017 1021 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AMPD3Q01432 767 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NAAAQ02083 359 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ACY1Q03154 408 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SQLEQ14534 574 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KIAA0040Q15053 153 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC22A6Q4U2R8 563 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC25A53Q5H9E4 307 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NHLRC3Q5JS37 347 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OTPQ5XKR4 325 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SDE2Q6IQ49 451 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DPPA4Q7L190 304 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SYT13Q7L8C5 426 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NAXDQ8IW45 347 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GCSAMQ8N6F7 178 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 EMC1Q8N766 993 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OR10G7Q8NGN6 311 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPPL2AQ8TCT8 520 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 STYXQ8WUJ0 223 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SGK494Q96LW2 274 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DRC1Q96MC2 740 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 COL21A1Q96P44 957 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TECTBQ96PL2 329 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ACOX2Q99424 681 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 EYA3Q99504 573 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PCGF1Q9BSM1 259 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PAXXQ9BUH6 204 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SHARPINQ9H0F6 387 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 THAP2Q9H0W7 228 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 VCXQ9H320 206 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CPVLQ9H3G5 476 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPC25Q9HBM1 224 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF446Q9NWS9 450 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RSPH14Q9UHP6 348 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PHF11Q9UIL8 331 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LAMB2P55268 1798 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LTBP1Q14766 1721 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF541Q9H0D2 1346 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 A0A1W2PRB8 838 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MFSD2BA6NFX1 497 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AQP12BA6NM10 295 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ACKR2O00590 384 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SCO2O43819 266 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PLA2G6O60733 806 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GLRA3O75311 464 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DEDDO75618 318 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CDK2AP2O75956 126 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ACTL6BO94805 426 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 STBD1O95210 358 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KCNK5O95279 499 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IGHV4-31P0DP07 118 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AOC1P19801 751 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CELP19835 753 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 POU1F1P28069 291 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MDH2P40926 338 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRIM2P49643 509 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PNLIPRP1P54315 467 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AP2B1P63010 937 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZBED6P86452 979 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DHODHQ02127 395 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TNIP1Q15025 636 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PPP2R5BQ15173 497 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TAB1Q15750 504 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GSG1Q2KHT4 349 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CHRFAM7AQ494W8 412 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF506Q5JVG8 444 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CBWD5Q5RIA9 395 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GARNL3Q5VVW2 1013 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TMTC3Q6ZXV5 915 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RRAGAQ7L523 313 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TADA2BQ86TJ2 420 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LINC01555Q8NAE3 123 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OR52B6Q8NGF0 335 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OR1J2Q8NGS2 313 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BRI3BPQ8WY22 251 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SH3KBP1Q96B97 665 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms