RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP4.05□□□□□ -1.763e-6■■■■□ 22.7
CENPF-201ENST00000366955 DPCR1Q3MIW9 517 aa4.05□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 EIPR1Q53HC9 387 aa4.05□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 TMEFF1Q8IYR6 380 aa4.05□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa4.05□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa4.05□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 C22orf15Q8WYQ4 148 aa4.05□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 FAM118BQ9BPY3 351 aa4.05□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 HRASLS2Q9NWW9 162 aa4.05□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 TCP11X1B4DZS4 312 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 RFXANKO14593 260 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CDH16O75309 829 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CD2P06729 351 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 GRIA2P42262 883 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CCR8P51685 355 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 GJA9P57773 515 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 SLC18A3Q16572 532 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 PTPN21Q16825 1174 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 QSOX2Q6ZRP7 698 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 PTCHD4Q6ZW05 846 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 TMC3Q7Z5M5 1100 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 LAS2Q8IYD9 372 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 RAB7BQ96AH8 199 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 DECR2Q9NUI1 292 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 KCNN3Q9UGI6 736 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 RAI2Q9Y5P3 530 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 LTN1O94822 1766 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ZNF878C9JN71 531 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 KCNK1O00180 336 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CLEC3BP05452 202 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 FNTBP49356 437 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CASP4P49662 377 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 RARRES1P49788 294 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 MTM1Q13496 603 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CCDC153Q494R4 210 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 EMBQ6PCB8 327 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ARPINQ7Z6K5 226 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 DTX3Q8N9I9 347 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ANKRD52Q8NB46 1076 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 DEFB124Q8NES8 71 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 TATDN2Q93075 761 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 C9orf72Q96LT7 481 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 BDH2Q9BUT1 245 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 Q9N2J8 555 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 AMACRQ9UHK6 382 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ZNF879B4DU55 563 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 FOXN2P32314 431 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CPOXP36551 454 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 GP5P40197 560 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 KIR2DL3P43628 341 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 STARP49675 285 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 TGFBR3Q03167 851 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 FAM189A2Q15884 450 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ZBTB6Q15916 424 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 MOGQ16653 247 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 C6orf141Q5SZD1 244 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 LCN1P1Q5VSP4 162 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 TMEM211Q6ICI0 200 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 TMEM17Q86X19 198 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 LRRC6Q86X45 466 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 GHDCQ8N2G8 530 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CRISPLD1Q9H336 500 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ERVK-5Q9HDB9 667 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 LTBP3Q9NS15 1303 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 MAFO75444 373 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 AHSA1O95433 338 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 BCL10O95999 233 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ECHS1P30084 290 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CDC25BP30305 580 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 SPIBQ01892 262 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 MPPED2Q15777 294 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 C9orf152Q5JTZ5 239 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 POLNQ7Z5Q5 900 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 GPR180Q86V85 440 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 S100PBPQ96BU1 408 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CPNE1Q99829 537 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 MAFFQ9ULX9 164 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 MYH13Q9UKX3 1938 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 A0A0G2JMP0 313 aa4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms