RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366662.8

TTC13-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-202ENST00000366662 BMP2P12643 396 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 PREPP48147 710 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 ARHGEF6Q15052 776 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 PPP4R4Q6NUP7 873 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 USP45Q70EL2 814 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 TMEM126BQ8IUX1 230 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 AQP12AQ8IXF9 295 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 AHI1Q8N157 1196 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 SELENOMQ8WWX9 145 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 INPP5KQ9BT40 448 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 OSBPL11Q9BXB4 747 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 LRTM1Q9HBL6 345 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 VCANP13611 3396 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 CTSAP10619 480 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 TCF3P15923 654 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 SLC5A2P31639 672 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 NSG1P42857 185 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 CCT8P50990 548 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 SLC7A9P82251 487 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 BNIP2Q12982 314 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 NKG7Q16617 165 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 MAPKAPK3Q16644 382 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 ANKFN1Q8N957 763 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 OR2A12Q8NGT7 310 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 VPS4AQ9UN37 437 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 COQ6Q9Y2Z9 468 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 MAPK10P53779 464 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 CARD16Q5EG05 197 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 MACC1Q6ZN28 852 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 FAM217AQ8IXS0 508 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 OR52E6Q96RD3 313 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 ADI1Q9BV57 179 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 HEBP1Q9NRV9 189 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 FAIMQ9NVQ4 179 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 SPATA7Q9P0W8 599 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 DMTF1Q9Y222 760 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 U3KQV3 271 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 ATG2BQ96BY7 2078 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 AP1G1O43747 822 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 SOCS5O75159 536 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 BCKDHAP12694 445 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 IRS1P35568 1242 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 GNPDA1P46926 289 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 GSTM4Q03013 218 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 LILRA6Q6PI73 481 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 CACUL1Q86Y37 369 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 SLC13A3Q8WWT9 602 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 TFAP2CQ92754 450 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 APIPQ96GX9 242 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 ABHD8Q96I13 439 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 ZFYVE19Q96K21 471 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 APOLD1Q96LR9 279 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 ZNF583Q96ND8 569 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 TRIM15Q9C019 465 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 TRMUO75648 421 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 ANXA5P08758 320 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 CD9P21926 228 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 HALP42357 657 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 SPINT3P49223 89 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 CCR3P51677 355 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 LAPTM4AQ15012 233 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 SULT1C3Q6IMI6 304 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 MSRB3Q8IXL7 192 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 ELMOD1Q8N336 334 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 ELMO1Q92556 727 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 GTF2H4Q92759 462 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 ZNF696Q9H7X3 374 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 LIMD1Q9UGP4 676 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 AXIN1O15169 862 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 RGS14O43566 566 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 PGRP06401 933 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 PRKACGP22612 351 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 RFC2P35250 354 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 HOXD12P35452 270 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 CDKN2CP42773 168 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 MERTKQ12866 999 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 ZBTB46Q86UZ6 589 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 SLC25A13Q9UJS0 675 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC13-202ENST00000366662 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms