RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 NPY2RP49146 381 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 ITGA1P56199 1179 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 RPS15P62841 145 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNJ11Q14654 390 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 TPSAB1Q15661 275 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 CTSL3PQ5NE16 218 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 LRRC8BQ6P9F7 803 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 C4orf22Q6V702 233 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 SYVN1Q86TM6 617 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 KIFC1Q9BW19 673 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 CLMPQ9H6B4 373 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR6C2Q9NZP2 312 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 BFARQ9NZS9 450 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 A0A0J9YY10 115 aa21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM63AO94886 807 aa21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 VAPBO95292 243 aa21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 RECKO95980 971 aa21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 TTPAP49638 278 aa21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 GPS1Q13098 491 aa21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 KYNUQ16719 465 aa21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCSMST1Q4G0I0 132 aa21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM151BQ8IW70 566 aa21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 ASZ1Q8WWH4 475 aa21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 SYTL2Q9HCH5 934 aa21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 SERTAD3Q9UJW9 196 aa21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 SOX13Q9UN79 622 aa21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 NFS1Q9Y697 457 aa21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 E7EQ34 232 aa21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 RFPL1O75677 317 aa21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLCO2B1O94956 709 aa21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 APOA4P06727 396 aa21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 PTGIRP43119 386 aa21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 BDKRB1P46663 353 aa21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNC4Q03721 635 aa21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 HOOK3Q86VS8 718 aa21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 OTUD6BQ8N6M0 293 aa21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM136AQ96C01 138 aa21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 TCTN2Q96GX1 697 aa21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 TSSK1BQ9BXA7 367 aa21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARGFXA6NJG6 315 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 NIPSNAP2O75323 286 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 NDUFS3O75489 264 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 KRT14P02533 472 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 CBSLP0DN79 551 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAGP20916 626 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 CBSP35520 551 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 CSRP3P50461 194 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 RAB28P51157 221 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 FOXL2P58012 376 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC5A12Q1EHB4 618 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 C1orf189Q5VU69 101 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 RASGEF1CQ8N431 466 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 DNAJC22Q8N4W6 341 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 LPGAT1Q92604 370 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 BIRC8Q96P09 236 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 NLNQ9BYT8 704 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 GALPQ9UBC7 116 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 GNPTGQ9UJJ9 305 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 TCFL5Q9UL49 500 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 SNX7Q9UNH6 387 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 NUP210LQ5VU65 1888 aa21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 F8W8V4 182 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 MKRN2OSH3BPM6 223 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAP3K7O43318 606 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR2B3O76000 313 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 RAB40ALP0C0E4 278 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 CASRP41180 1078 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAGEA6P43360 314 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 KIR2DS3Q14952 304 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMED2Q15363 201 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 UNC5DQ6UXZ4 953 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 HOMER3Q9NSC5 361 aa21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCM1Q15154 2024 aa21.89■■□□□ 1.1
TNFRSF25-201ENST00000348333 CD9P21926 228 aa21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF25-201ENST00000348333 FMO4P31512 558 aa21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDK16Q00536 496 aa21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC9A5Q14940 896 aa21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms