RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SHDQ96IW2 340 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MRGPRX1Q96LB2 322 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 BTBD10Q9BSF8 475 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TEX101Q9BY14 249 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LRMDAQ9H2I8 198 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC32A1Q9H598 525 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBTB26Q9HCK0 441 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGEF3Q9NR81 526 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MMP17Q9ULZ9 603 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CHUKO15111 745 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KMOO15229 486 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 EBLN1P0CF75 366 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 NQO1P15559 274 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 HMOX2P30519 316 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ADPRHP54922 357 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CTBSQ01459 385 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PRKCQQ04759 706 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CHSY3Q70JA7 882 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SYVN1Q86TM6 617 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM74Q86UV6 250 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRTM4Q86VH4 590 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP24Q8N264 748 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 HM13Q8TCT9 377 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TWIST2Q8WVJ9 160 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 NELL2Q99435 816 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 NTMT1Q9BV86 223 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 RMI1Q9H9A7 625 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SGK2Q9HBY8 427 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CD248Q9HCU0 757 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 RIC8BQ9NVN3 520 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC100653049A0A140TA62 436 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM202A6NGA9 273 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC31A1O15431 190 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LILRB5O75023 590 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT34O76011 436 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4F21O95013 312 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00032P0C843 101 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 HGFP14210 728 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LBPP18428 481 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CD72P21854 359 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 GDF5P43026 501 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PREPP48147 710 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 STX1BP61266 288 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MXRA7P84157 204 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KLF10Q13118 480 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC32Q14392 662 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS6KA2Q15349 733 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 DOK6Q6PKX4 331 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM124AQ86V42 546 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TREML1Q86YW5 311 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 RASGRP3Q8IV61 690 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CDYL2Q8N8U2 506 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KLK6Q92876 244 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MCUR1Q96AQ8 359 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXL8Q96CD0 374 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TUBGCP3Q96CW5 907 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC6A17Q9H1V8 727 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf21Q9H246 121 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 RUBCNLQ9H714 662 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ITM2CQ9NQX7 267 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ACSL5Q9ULC5 683 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TIMM22Q9Y584 194 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LAMA3Q16787 3333 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms