RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 KCNK2O95069 426 aa19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 GJA1P17302 382 aa19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 PCMT1P22061 227 aa19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 TAF12Q16514 161 aa19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 C5orf22Q49AR2 442 aa19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 ALG1LQ6GMV1 187 aa19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 LAIR2Q6ISS4 152 aa19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 ELMOD1Q8N336 334 aa19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 CWH43Q9H720 699 aa19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 ANKRD66B4E2M5 251 aa19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 EPOP01588 193 aa19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 TGFBR1P36897 503 aa19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 NCS1P62166 190 aa19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 BOCQ9BWV1 1114 aa19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 YIPF1Q9Y548 306 aa19■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 TNFRSF10AO00220 468 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 XPNPEP2O43895 674 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 GABARAPO95166 117 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 TSPAN12O95859 305 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 UMPSP11172 480 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 SPNP16150 400 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 IL12AP29459 219 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 SLC26A3P40879 764 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 DGCR6Q14129 220 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 RBBP7Q16576 425 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 DEFB115Q30KQ5 88 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 ADGRF1Q5T601 910 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 GALNT7Q86SF2 657 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 APCDD1Q8J025 514 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM199Q8N511 208 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 POC5Q8NA72 575 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 FNDC5Q8NAU1 212 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 BPIFB1Q8TDL5 484 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 TBC1D14Q9P2M4 693 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 H0Y626 953 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 SNX2O60749 519 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 CLDN11O75508 207 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 CDH1P12830 882 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 SUOXP51687 545 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 SELPLGQ14242 412 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 CLDN19Q8N6F1 224 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 OR2T11Q8NH01 316 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 IGSF21Q96ID5 467 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 CPNE5Q9HCH3 593 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 AIG1Q9NVV5 245 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 TTC34A8MYJ7 566 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 EEDO75530 441 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 ITIH1P19827 911 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 HOXD10P28358 340 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 MTHFRP42898 656 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 SERPINB10P48595 397 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 LAPTM5Q13571 262 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 E2F2Q14209 437 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 ANKS6Q68DC2 871 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 SYVN1Q86TM6 617 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 DTWD1Q8N5C7 304 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 OR52B6Q8NGF0 335 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 ITFG1Q8TB96 612 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 LINGO1Q96FE5 620 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 ITM2CQ9NQX7 267 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 TAS2R13Q9NYV9 303 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 A0A1B0GVM2 712 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 RGS13O14921 159 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 SLC22A1O15245 554 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 TBX1O43435 398 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 CSKP41240 450 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 LYSMD2Q8IV50 215 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 FAR1Q8WVX9 515 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 BTBD2Q9BX70 525 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 TESMINQ9Y4I5 508 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 CHD9Q3L8U1 2897 aa18.98■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa18.97■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 C2orf81A6NN90 581 aa18.97■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 SLC1A7O00341 560 aa18.97■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 BNIP3LO60238 219 aa18.97■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 GSNP06396 782 aa18.97■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 CXCR2P25025 360 aa18.97■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 MAP2K4P45985 399 aa18.97■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 PPP5CP53041 499 aa18.97■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
ZNF554-201ENST00000317243 CYP4F8P98187 520 aa18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms