RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 SP140Q13342 867 aa21.66■■□□□ 1.06
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HOXD4-201ENST00000306324 PHF19Q5T6S3 580 aa21.66■■□□□ 1.06
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HOXD4-201ENST00000306324 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
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HOXD4-201ENST00000306324 SPINK2P20155 84 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 HIST1H2ADP20671 130 aa21.64■■□□□ 1.05
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HOXD4-201ENST00000306324 LINC01555Q8NAE3 123 aa21.64■■□□□ 1.05
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HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD7Q92527 254 aa21.64■■□□□ 1.05
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HOXD4-201ENST00000306324 SLC16A8O95907 504 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 C9P02748 559 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 THRAP10827 490 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 CD1DP15813 335 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ATP6V0D1P61421 351 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 TSNQ15631 228 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ANKS6Q68DC2 871 aa21.63■■□□□ 1.05
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