RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 PDZD3Q86UT5 571 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SCUBE1Q8IWY4 988 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 OR9I1Q8NGQ6 314 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 PKP4Q99569 1192 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 AIG1Q9NVV5 245 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 NDE1Q9NXR1 346 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SLC22A14Q9Y267 594 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 LRP4O75096 1905 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 PCM1Q15154 2024 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 KMOO15229 486 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 CIB2O75838 187 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SLC16A8O95907 504 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 KRT6AP02538 564 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 KRT6BP04259 564 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 CD72P21854 359 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 GPX3P22352 226 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 IMPA1P29218 277 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 KRT6CP48668 564 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 RAP1GDS1P52306 607 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 PFN3P60673 137 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 RPS6KA2Q15349 733 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SLC44A4Q53GD3 710 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 UNC5DQ6UXZ4 953 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 PACS2Q86VP3 889 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 DEFB107AQ8IZN7 70 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 FNDC5Q8NAU1 212 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 KYQ8NBH2 561 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 HLA-CQ95604 372 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 MED8Q96G25 268 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 CLPTM1LQ96KA5 538 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SLC25A23Q9BV35 468 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 OR52A5Q9H2C5 316 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 FZD3Q9NPG1 666 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 CIDEBQ9UHD4 219 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 KLHL33A6NCF5 533 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 MANBAO00462 879 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 NR5A2O00482 541 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 LSM1O15116 133 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 RGS14O43566 566 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 ULK1O75385 1050 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 DIO3P55073 304 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 STX5Q13190 355 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 ART3Q13508 389 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 C6orf136Q5SQH8 315 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 WASHC2DQ5SRD0 308 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 PAOXQ6QHF9 649 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 Q6ZSR9 355 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SFRP1Q8N474 314 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 USP7Q93009 1102 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 PPP3R2Q96LZ3 170 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 MYOCQ99972 504 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 C1orf50Q9BV19 199 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 EFCAB1Q9HAE3 211 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 CD93Q9NPY3 652 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SNX6Q9UNH7 406 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 GPR45Q9Y5Y3 372 aa10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 A0A088AWK7 358 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SLC28A1O00337 649 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 MAN2B1O00754 1011 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SLC31A1O15431 190 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 UGDHO60701 494 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 GABRG2P18507 467 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 ACADLP28330 430 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 HALP42357 657 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 TPMTP51580 245 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 NME5P56597 212 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 TBPL1P62380 186 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 NAE1Q13564 534 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 IMPG1Q17R60 797 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 MMEL1Q495T6 779 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 C6orf163Q5TEZ5 329 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 REP15Q6BDI9 236 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 DSELQ8IZU8 1212 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 PGAM4Q8N0Y7 254 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 L3MBTL4Q8NA19 623 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 DENND6BQ8NEG7 585 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 OR56A3Q8NH54 315 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 MAGEC3Q8TD91 643 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 HMGB4Q8WW32 186 aa10.21□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 ASB12Q8WXK4 309 aa10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms