RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIB3Q96RU7 358 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXC2Q99958 501 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF160Q9HCG1 818 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 IL26Q9NPH9 171 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PTGFRNQ9P2B2 879 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 CRLS1Q9UJA2 301 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.55□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5H15A6NDH6 313 aa7.55□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ISM1B1AKI9 464 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 IDSB3KWA1 339 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 E9PLN8 166 aa7.55□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 EPHB6O15197 1021 aa7.55□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ZWINTO95229 277 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ONECUT2O95948 504 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 EPOP01588 193 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINA7P05543 415 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PVRP15151 417 aa7.55□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 ADORA2A-AS1P86434 159 aa7.55□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM211Q6ICI0 200 aa7.55□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 UGT1A7Q9HAW7 530 aa7.55□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 MEMO1Q9Y316 297 aa7.55□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa7.54□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 FAM227AF5H4B4 570 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 C19orf84I3L1E1 186 aa7.54□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 PRR35P0CG20 571 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 UGT2B7P16662 529 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGALP20701 1170 aa7.54□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 KIR3DL1P43629 444 aa7.54□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 GHDCQ8N2G8 530 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB42Q8N4Z0 105 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAAF3Q8N9W5 541 aa7.54□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 SDCCAG3Q96C92 435 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR137Q96N19 417 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ERGIC2Q96RQ1 377 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 COPS8Q99627 209 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 FERMT1Q9BQL6 677 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 HGH1Q9BTY7 390 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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