RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291592.5

LRRC3-201, Transcript of leucine rich repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC3, Length 5,869 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3-201ENST00000291592 VIPP01282 170 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 IQCCQ4KMZ1 466 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 METTL21AQ8WXB1 218 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 ACBD6Q9BR61 282 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 JAG1P78504 1218 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 RFWD3Q6PCD5 774 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 MFSD3Q96ES6 412 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 FEM1CQ96JP0 617 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 LMLNQ96KR4 655 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 LGALS13Q9UHV8 139 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 IGFBP4P22692 258 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 CMPK1P30085 196 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 ZNF627Q7L945 461 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 PHC3Q8NDX5 983 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 MSRAQ9UJ68 235 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 SLC22A1O15245 554 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 PRAMEF12O95522 483 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 GLUD1P00367 558 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 C1RP00736 705 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 SLC39A3Q9BRY0 314 aa16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 L7N2F9 121 aa16.33■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 LAG3P18627 525 aa16.33■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 ALAS2P22557 587 aa16.33■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 LMO2P25791 158 aa16.33■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 VAMP2P63027 116 aa16.33■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 DSC2Q02487 901 aa16.33■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 HERC3Q15034 1050 aa16.33■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 GXYLT1Q4G148 440 aa16.33■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 FSTL4Q6MZW2 842 aa16.33■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 OR2L8Q8NGY9 312 aa16.33■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa16.33■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 CFAP97Q9P2B7 532 aa16.33■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa16.33■□□□□ 0.21
LRRC3-201ENST00000291592 ACOX3O15254 700 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 NPHS1O60500 1241 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP16.33■□□□□ 0.24e-10■□□□□ 9.8
LRRC3-201ENST00000291592 OCLNQ16625 522 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 SH3D19Q5HYK7 790 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 PLPP4Q5VZY2 271 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 TUBA3EQ6PEY2 450 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 PYROXD2Q8N2H3 581 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 OR1F1O43749 312 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 SLC13A3Q8WWT9 602 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 TMEM109Q9BVC6 243 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 TREM1Q9NP99 234 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 PLK2Q9NYY3 685 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 COQ4Q9Y3A0 265 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 PNLIPRP1P54315 467 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 MTPNP58546 118 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 HEPACAMQ14CZ8 416 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 MSANTD2Q6P1R3 559 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 ASB18Q6ZVZ8 466 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 SLC35G5Q96KT7 338 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 TMEM168Q9H0V1 697 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 ABCG4Q9H172 646 aa16.33■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 C2CD4BA6NLJ0 364 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 CCNCP24863 283 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 NDUFV1P49821 464 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 ANKRD22Q5VYY1 191 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 FAM129CQ86XR2 697 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 FAM110BQ8TC76 370 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 OR2AG2A6NM03 316 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 GNB5O14775 395 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 PCSK2P16519 638 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 MAN2A2P49641 1150 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 SP2Q02086 613 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 CFAP206Q8IYR0 622 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 PTPN18Q99952 460 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 OSBPL7Q9BZF2 842 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 SDCBP2Q9H190 292 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 TRPV4Q9HBA0 871 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 C1orf109Q9NX04 203 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRC3-201ENST00000291592 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms