RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283351.8

TRAPPC8-201, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC8, Length 6,226 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-201ENST00000283351 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 A0A1W2PQ72 361 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 RFPL2O75678 378 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 CYP17A1P05093 508 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 GALTP07902 379 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZNF20P17024 532 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 CAPGP40121 348 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 PXNP49023 591 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 PXYLP1Q8TE99 480 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 RGMAQ96B86 450 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 RADILQ96JH8 1075 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 DEPDC5O75140 1603 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 OR51F1A6NGY5 319 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 G3V2T6 193 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 HAT1O14929 419 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 DUX1O43812 170 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 NME6O75414 186 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 CYP11A1P05108 521 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 TPSB2P20231 275 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 IL12RB1P42701 662 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 TPSAB1Q15661 275 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 PCDHGC3Q9UN70 934 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 PADI2Q9Y2J8 665 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 NPIPA5E9PKD4 350 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 PLIN3O60664 434 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 DLDP09622 509 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 CTBP2P56545 445 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 LCP2Q13094 533 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 DECR1Q16698 335 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 CREG2Q8IUH2 290 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 FUT8Q9BYC5 575 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 MARCH7Q9H992 704 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 ITM2CQ9NQX7 267 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 A0A087WXM4 84 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 AP5Z1O43299 807 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 ID2Q02363 134 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 RIPK1Q13546 671 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 FAM3CQ92520 227 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 PPM1HQ9ULR3 514 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 A0A1W2PPM1 405 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 PLOD3O60568 738 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 LRRC66Q68CR7 880 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 GJD3Q8N144 294 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 SMPDL3AQ92484 453 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 BRF2Q9HAW0 419 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 Q9N2J8 555 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 SATB2Q9UPW6 733 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 PPEF2O14830 753 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 IQCF3P0C7M6 154 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 TGFBR2P37173 567 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 OR10H4Q8NGA5 316 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 KCTD13Q8WZ19 329 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 COX4I2Q96KJ9 171 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 TCF12Q99081 682 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZNF222Q9UK12 451 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 SNX7Q9UNH6 387 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 FSCN2O14926 492 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 CACNA2D1P54289 1103 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 CDH12P55289 794 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 SEMA3AQ14563 771 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 TTLL10Q6ZVT0 673 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 CEP97Q8IW35 865 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 SMARCD2Q92925 531 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 TESCQ96BS2 214 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 TPK1Q9H3S4 243 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 CCDC162PA2VCL2 907 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 H3BQF6 201 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 FABP3P05413 133 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC10A7Q0GE19 358 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC8-201ENST00000283351 GPR33Q49SQ1 333 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms