RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 SLCO2B1O94956 709 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 ADH1BP00325 375 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 EZRP15311 586 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 PKNOX1P55347 436 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 SESN3P58005 492 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 ANO7Q6IWH7 933 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 CYP2U1Q7Z449 544 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 C11orf96Q7Z7L8 435 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 FAM156AQ8NDB6 213 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 PKP4Q99569 1192 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 SLC12A9Q9BXP2 914 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 SLC17A9Q9BYT1 436 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 ACTR8Q9H981 624 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 L3MBTL1Q9Y468 752 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 SLC5A10A0PJK1 596 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 K7EPI3 171 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 ATP5HO75947 161 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 MLYCDO95822 493 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 FGF4P08620 206 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 EPB42P16452 691 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 ITGAXP20702 1163 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 HMOX2P30519 316 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 RASSF2P50749 326 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 GBX1Q14549 363 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 COL19A1Q14993 1142 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 TPRG1LQ5T0D9 272 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 SULT1C3Q6IMI6 304 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 Q6ZSR9 355 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 NLRP8Q86W28 1048 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 OR5AR1Q8NGP9 310 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 CLHC1Q8NHS4 586 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 MCOLN3Q8TDD5 553 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 C19orf43Q9BQ61 176 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 WDR26Q9H7D7 661 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 SH2B3Q9UQQ2 575 aa10.7□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 BDP1A6H8Y1 2624 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 GFYI3L273 518 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 ACADMP11310 421 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 CASP2P42575 452 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 GTF2H3Q13889 308 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 VPS26BQ4G0F5 336 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 HPS6Q86YV9 775 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 SFRP1Q8N474 314 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 VPS33AQ96AX1 596 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 GABRG3Q99928 467 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 TPSD1Q9BZJ3 242 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF385DQ9H6B1 395 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 ABCA7Q8IZY2 2146 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 DYTNA2CJ06 578 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 CFAP73A6NFT4 308 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 NR5A2O00482 541 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 PEX14O75381 377 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 UROSP10746 265 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 HALP42357 657 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 DPTQ07507 201 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 FUNDC1Q8IVP5 155 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 SYTL1Q8IYJ3 562 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 FNDC5Q8NAU1 212 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 RAB7BQ96AH8 199 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 CMTM5Q96DZ9 223 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF382Q96SR6 550 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 TRIM54Q9BYV2 358 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 FOXQ1Q9C009 403 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 RAD18Q9NS91 495 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 EBF1Q9UH73 591 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 WDR37Q9Y2I8 494 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 ST14Q9Y5Y6 855 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 NCOR1O75376 2440 aa10.69□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa10.68□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 E7EQ34 232 aa10.68□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 AP2A2O94973 939 aa10.68□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 MATN4O95460 622 aa10.68□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 CBSLP0DN79 551 aa10.68□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 FOSL2P15408 326 aa10.68□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 CYP2A7P20853 494 aa10.68□□□□□ -0.7
GGPS1-201ENST00000282841 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms