RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273317.4

LIMD1-201, Transcript of LIM domains containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD1, Length 11,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-201ENST00000273317 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 PMM2O15305 246 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 CLCN7P51798 805 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 TSTD2Q5T7W7 516 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 HGSNATQ68CP4 663 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 ABHD13Q7L211 337 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 OR2AG2A6NM03 316 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 UGT1A9O60656 530 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 C1RP00736 705 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 UGT1A6P19224 532 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 PRPS1L1P21108 318 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 UGT1A1P22309 533 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 UGT1A4P22310 534 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 GLDCP23378 1020 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 GRIA2P42262 883 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 MASP1P48740 699 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 RPIAP49247 311 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 C12orf29Q8N999 325 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 CPXM1Q96SM3 734 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 SLC39A3Q9BRY0 314 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 UGT1A7Q9HAW7 530 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 UGT1A10Q9HAW8 530 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 UGT1A8Q9HAW9 530 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 ITM2CQ9NQX7 267 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF69Q9UC07 566 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 ACOX3O15254 700 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 OR1I1O60431 355 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 MAGEA12P43365 314 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 SCARB2Q14108 478 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 VGLL4Q14135 290 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 KLHDC10Q6PID8 442 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 HID1Q8IV36 788 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 RGL4Q8IZJ4 473 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 OR56A1Q8NGH5 318 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 TRPM4Q8TD43 1214 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 BRSK1Q8TDC3 778 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 CNTN3Q9P232 1028 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 L7N2F9 121 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 MSI1O43347 362 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 IFNA21P01568 189 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF806P0C7X5 589 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 VAMP2P63027 116 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 PCDH1Q08174 1060 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 DAG1Q14118 895 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 RHEBQ15382 184 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 RELTQ969Z4 430 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 FAM84AQ96KN4 292 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 PTPRJQ12913 1337 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 FSHRP23945 695 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 MERTKQ12866 999 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 MAB21L1Q13394 359 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 CLEC6AQ6EIG7 209 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 OR5B17Q8NGF7 314 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 THAP6Q8TBB0 222 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 ATPIF1Q9UII2 106 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 DUXAA6NLW8 204 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 PIP5K1BO14986 540 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF599Q96NL3 588 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 MED31Q9Y3C7 131 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 PLIN4Q96Q06 1357 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 ARPC2O15144 300 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 GADD45GO95257 159 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 PGAM2P15259 253 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 MAP2K5Q13163 448 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF781Q8N8C0 355 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 GLIS3Q8NEA6 775 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 HAPLN3Q96S86 360 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 PDZD7Q9H5P4 517 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 HHATLQ9HCP6 504 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 ACP6Q9NPH0 428 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 C5orf51A6NDU8 294 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 GOT2P00505 430 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 CBSLP0DN79 551 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 F8A1P23610 371 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 CBSP35520 551 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 PTGIRP43119 386 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 IST1P53990 364 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 PON3Q15166 354 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 TMEM139Q8IV31 216 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 OR10A6Q8NH74 314 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 DUSP26Q9BV47 211 aa7.83□□□□□ -1.16
LIMD1-201ENST00000273317 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms