RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 ANXA6P08133 673 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 HTR1AP08908 422 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 HMGCLP35914 325 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 RPIAP49247 311 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 BNIP2Q12982 314 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 USP41Q3LFD5 358 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 NEK5Q6P3R8 708 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 GAREM2Q75VX8 874 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ZBTB2Q8N680 514 aa8.47□□□□□ -1.05
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GINS1-201ENST00000262460 RHBDF1Q96CC6 855 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 MED8Q96G25 268 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 LRTM1Q9HBL6 345 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PHF24Q9UPV7 400 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ITM2BQ9Y287 266 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 BTBD3Q9Y2F9 522 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CXCR6O00574 342 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 STX16O14662 325 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 RAD51BO15315 384 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ESR1P03372 595 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 MAGP20916 626 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 JAK1P23458 1154 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 HALP42357 657 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CD47Q08722 323 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PON2Q15165 354 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 DPY19L1Q2PZI1 675 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PTCHD3Q3KNS1 767 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CARD16Q5EG05 197 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 LAIR2Q6ISS4 152 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 RIMKLAQ8IXN7 391 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 OR52J3Q8NH60 311 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 TPD52L3Q96J77 140 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 SPATA17Q96L03 361 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 MBOAT4Q96T53 435 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 LINC00597Q9H2U6 94 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 EPB41L1Q9H4G0 881 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PARVBQ9HBI1 364 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 MANBAO00462 879 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PER2O15055 1255 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ALPLP05186 524 aa8.46□□□□□ -1.05
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GINS1-201ENST00000262460 THRBP10828 461 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 COL6A1P12109 1028 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
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GINS1-201ENST00000262460 PTGER1P34995 402 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 IL5RAQ01344 420 aa8.46□□□□□ -1.05
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GINS1-201ENST00000262460 PERM1Q5SV97 790 aa8.46□□□□□ -1.05
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GINS1-201ENST00000262460 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.46□□□□□ -1.05
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GINS1-201ENST00000262460 ZNF461Q8TAF7 563 aa8.46□□□□□ -1.05
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GINS1-201ENST00000262460 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 SRRDQ9UH36 339 aa8.46□□□□□ -1.05
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GINS1-201ENST00000262460 OTCP00480 354 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TRBC1P01850 177 aa8.46□□□□□ -1.06
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GINS1-201ENST00000262460 SREBF2Q12772 1141 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 AQP6Q13520 282 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PWP1Q13610 501 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 KIAA0040Q15053 153 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ZBED5Q49AG3 693 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PRMT9Q6P2P2 845 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TMEM25Q86YD3 366 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
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