RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 ELMOD1Q8N336 334 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 SETD9Q8NE22 299 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 YME1L1Q96TA2 773 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 KATNBL1Q9H079 304 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 NMUR1Q9HB89 426 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 GMPPBQ9Y5P6 360 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 DSCR3O14972 297 aa20.08■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 DIRAS1O95057 198 aa20.08■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 SCELO95171 688 aa20.08■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 PGLSO95336 258 aa20.08■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 SMPD1P17405 629 aa20.08■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 PIK3CGP48736 1102 aa20.08■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 CLK1P49759 484 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 HUNKP57058 714 aa20.08■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 TRAF3Q13114 568 aa20.08■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 CCDC103Q8IW40 242 aa20.08■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 PARP16Q8N5Y8 322 aa20.08■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 ELMO1Q92556 727 aa20.08■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 CEP44Q9C0F1 390 aa20.08■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 TMEM45AQ9NWC5 275 aa20.08■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 CLDN24A6NM45 220 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 OR1I1O60431 355 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 PTTG1O95997 202 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 B3GALT4O96024 378 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 HOXA9P31269 272 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 GRK5P34947 590 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 TRPC1P48995 793 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 MAPKAPK3Q16644 382 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 SCD5Q86SK9 330 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 GPSM1Q86YR5 675 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 OR4F6Q8NGB9 312 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 DHRS1Q96LJ7 313 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 OR7A17O14581 309 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 CCNKO75909 580 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 ALOX12P18054 663 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 GADD45AP24522 165 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 HTR7P34969 479 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 PTPRNQ16849 979 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 TPRG1LQ5T0D9 272 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 LINGO1Q96FE5 620 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 SIGLEC11Q96RL6 698 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 MMP27Q9H306 513 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 MIOSQ9NXC5 875 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 H0Y626 953 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 TAF4O00268 1085 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 WBP4O75554 376 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 TRIM16O95361 564 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 RETP07949 1114 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 BMP1P13497 986 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 SLC2A4P14672 509 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 GTF2H3Q13889 308 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 FKBP9P1Q75LS8 142 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.06■□□□□ 0.8
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PMS1-222ENST00000639501 TEX26Q8N6G2 289 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 CLHC1Q8NHS4 586 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 MAGIXQ9H6Y5 334 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 PARVBQ9HBI1 364 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 SAGE2PA6NJ88 616 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 M0R082 166 aa20.06■□□□□ 0.8
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PMS1-222ENST00000639501 KEAP1Q14145 624 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 PLEKHG6Q3KR16 790 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 KDM4DQ6B0I6 523 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 ZNF683Q8IZ20 524 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 IL17RDQ8NFM7 739 aa20.06■□□□□ 0.8
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PMS1-222ENST00000639501 FBXL12Q9NXK8 326 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 CCL27Q9Y4X3 112 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-222ENST00000639501 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa20.06■□□□□ 0.8
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