RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631043.2

TCF4-275, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 510 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-275	ENST00000631043	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	RANBP9	Q96S59	729 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SH3GL1	Q99961	368 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	APOL2	Q9BQE5	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	MECR	Q9BV79	373 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	C1orf21	Q9H246	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SAR1A	Q9NR31	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	OBSL1	O75147	1896 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	CENPF	P49454	3210 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043		A0A096LPK6	155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	LCHN	A4D1U4	455 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043		F5H5T6	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	CBX4	O00257	560 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	UBE2C	O00762	179 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	FCHO1	O14526	889 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SMPD2	O60906	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ZNF254	O75437	659 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	CBX6	O95503	412 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	GSR	P00390	522 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	AMY2A	P04746	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	FGF1	P05230	155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	GALT	P07902	379 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	KRT16	P08779	473 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	NR2F1	P10589	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	MYL2	P10916	166 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	AMY2B	P19961	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	CALB2	P22676	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	NMBR	P28336	390 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	TYK2	P29597	1187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SLC8A1	P32418	973 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	RFC2	P35250	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	HSPA7	P48741	367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	CLCN5	P51795	746 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	PRKAA2	P54646	552 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	WNT3A	P56704	352 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SCAND1	P57086	179 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	VAMP2	P63027	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	HTD2	P86397	168 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	IL10RB	Q08334	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	TAF10	Q12962	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	STX3	Q13277	289 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ZNF235	Q14590	738 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	POU6F1	Q14863	301 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	GPNMB	Q14956	572 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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