RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 TERF2Q15554 542 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 PACS1Q6VY07 963 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 SH2D5Q6ZV89 423 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 KDELC2Q7Z4H8 507 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNMB4Q86W47 210 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD66B4E2M5 251 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 LDB2O43679 373 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 CRTAMO95727 393 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF28P17035 718 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 HADHAP40939 763 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 CD97P48960 835 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE1BQ01064 536 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC18A2Q05940 514 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 CES3Q6UWW8 571 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA0408Q6ZU52 694 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 GALNT7Q86SF2 657 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 CALML6Q8TD86 181 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ACMSDQ8TDX5 336 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF778Q96MU6 729 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 MCMBPQ9BTE3 642 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 EFHD1Q9BUP0 239 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 TXNDC16Q9P2K2 825 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNK6Q9Y257 313 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNMB2Q9Y691 235 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 UNC79Q9P2D8 2635 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR19A6NJB7 356 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 FADS2P1A8MWK0 482 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 FURINP09958 794 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 ERVK-10P10266 1014 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 SPRP35270 261 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 EPHA4P54764 986 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP7Q14244 749 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM26EQ8N5C1 309 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 STYXQ8WUJ0 223 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 SGSM3Q96HU1 749 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM167BQ9BTA0 163 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 CHKBQ9Y259 395 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 NOTCH2Q04721 2471 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 ICE1Q9Y2F5 2266 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 TYROBPO43914 113 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN7O95471 211 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 PYGLP06737 847 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD34CP0C6C1 535 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 GFERP55789 205 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF31Q96EP0 1072 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 LYSMD1Q96S90 227 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 ZMYND15Q9H091 742 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 MKS1Q9NXB0 559 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.364e-11■□□□□ 10.6
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL3Q9UH77 587 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PPM1 405 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM120BA0PK00 339 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 PIAS1O75925 651 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 ASMTLO95671 621 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 C9P02748 559 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 ACP5P13686 325 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 F3P13726 295 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 TCN2P20062 427 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 ARNTP27540 789 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 C16orf46Q6P387 395 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 BANPQ8N9N5 519 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 DENND1AQ8TEH3 1009 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 ISL2Q96A47 359 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC134Q9H6E4 229 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEE1Q9HCI5 957 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 CPNE7Q9UBL6 633 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 HMX2A2RU54 273 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM49D1C9J1S8 452 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 VAPBO95292 243 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT4P19013 534 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 MC1RQ01726 317 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 QPCTQ16769 361 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 NEPROQ6NW34 567 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 ESX1Q8N693 406 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 OR13J1Q8NGT2 312 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3KBP1Q96B97 665 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 RBBP8Q99708 897 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms