RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 CBSLP0DN79 551 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 UGT2B7P16662 529 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 TPH1P17752 444 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 SHMT2P34897 504 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 CBSP35520 551 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 GABRA4P48169 554 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 RWDD2BP57060 319 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 CACNG1Q06432 222 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 ZIC1Q15915 447 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 DBN1Q16643 649 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 MLIPQ5VWP3 458 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 RHBDD2Q6NTF9 364 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM73Q86UV7 250 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 OR2A14Q96R47 310 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 RCCD1A6NED2 376 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 ACADLP28330 430 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 PARP6Q2NL67 630 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 AADACL2Q6P093 401 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 STYXQ8WUJ0 223 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 ALG3Q92685 438 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 GBP5Q96PP8 586 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 CASS4Q9NQ75 786 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 MAP10Q9P2G4 905 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 ASF1AQ9Y294 204 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 PRSS21Q9Y6M0 314 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 MYO9AB2RTY4 2548 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 DDAH2O95865 285 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 TPBGLP0DKB5 382 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 CETN2P41208 172 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 NSG1P42857 185 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 POU6F1Q14863 301 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 DEFB110Q30KQ9 67 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf189Q5VU69 101 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D21Q8IYX1 336 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 PROKR1Q8TCW9 393 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 C19orf60Q96EN9 201 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC40Q9H9A6 602 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 SPHK1Q9NYA1 384 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 OR6C2Q9NZP2 312 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 DUSP10Q9Y6W6 482 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 KRT86O43790 486 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 METTL18O95568 372 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 CD63P08962 238 aa24.05■■□□□ 1.44
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PTPRF-216ENST00000617451 DCDP81605 110 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 ITIH4Q14624 930 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 KYNUQ16719 465 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 DCAF10Q5QP82 559 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 TMTC1Q8IUR5 882 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 PRR7Q8TB68 274 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 ELMO1Q92556 727 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 POLG2Q9UHN1 485 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0J9YY10 115 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 MROH6A6NGR9 719 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 QSOX1O00391 747 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 IGHEP01854 428 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 CTSBP07858 339 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 FOLR3P41439 243 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 MYBPC3Q14896 1274 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 IGFL3Q6UXB1 125 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 PACS1Q6VY07 963 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 IQCKQ8N0W5 287 aa24.04■■□□□ 1.44
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PTPRF-216ENST00000617451 OR2Y1Q8NGV0 311 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 OR5K2Q8NHB8 316 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 AP1M1Q9BXS5 423 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC88CQ9P219 2028 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 SLC5A10A0PJK1 596 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 PEX12O00623 359 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 FTH1P02794 183 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 ALPPP05187 535 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 BRD3Q15059 726 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 TLDC1Q6P9B6 456 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJC22Q8N4W6 341 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 PTERQ96BW5 349 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.03■■□□□ 1.44
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