RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	CARD6	Q9BX69	1037 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	SNX7	Q9UNH6	387 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197		A0A0J9YY10	115 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197		H3BMM5	538 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	MEN1	O00255	615 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR1I1	O60431	355 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR2B3	O76000	313 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CD63	P08962	238 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	MSL3P1	P0C860	447 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ST6GAL1	P15907	406 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	UGT2B7	P16662	529 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACADL	P28330	430 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CXCR5	P32302	372 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	NFKB2	Q00653	900 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACVR1	Q04771	509 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ABR	Q12979	859 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	KIR2DS3	Q14952	304 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	UGT8	Q16880	541 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARMC3	Q5W041	872 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PBK	Q96KB5	322 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PPM1M	Q96MI6	270 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHST8	Q9H2A9	424 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACSS2	Q9NR19	701 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ICK	Q9UPZ9	632 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	VAPB	O95292	243 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PVR	P15151	417 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	TPSB2	P20231	275 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	MGAT1	P26572	445 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	KCNJ1	P48048	391 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	VPS41	P49754	854 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	RAB28	P51157	221 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PMS2	P54278	862 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	KLRB1	Q12918	225 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	GPS1	Q13098	491 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	GPS2	Q13227	327 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	TPSAB1	Q15661	275 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	RAB43	Q86YS6	212 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR1L3	Q8NH93	324 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF778	Q96MU6	729 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	NDC1	Q9BTX1	674 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	NLN	Q9BYT8	704 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRIM4	Q9C037	500 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAGEB16	A2A368	324 aa		10.59	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197		E5RI56	91 aa		10.59	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZSCAN12	O43309	604 aa		10.59	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF749	O43361	778 aa		10.59	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	S1PR4	O95977	384 aa		10.59	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCR7	P32248	378 aa		10.59	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCNF	P41002	786 aa		10.59	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PGD	P52209	483 aa		10.59	□□□□□ -0.71

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