RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 SGSM3Q96HU1 749 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SLC41A2Q96JW4 573 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PPM1MQ96MI6 270 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PANX3Q96QZ0 392 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CARD6Q9BX69 1037 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SPRY4Q9C004 299 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL25Q9H0H3 589 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ACTR10Q9NZ32 417 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SAMD15Q9P1V8 674 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 POLG2Q9UHN1 485 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 GNPTGQ9UJJ9 305 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PADI1Q9ULC6 663 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SLC5A10A0PJK1 596 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEB16A2A368 324 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SDR42E2A6NKP2 422 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 EFCAB8A8MWE9 144 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ISM1B1AKI9 464 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 BTN3A1O00481 513 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 KPNA5O15131 536 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF185O15231 689 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 NKX2-8O15522 239 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PHF2O75151 1096 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 DLGAP3O95886 979 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 RPN2P04844 631 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ITGB2P05107 769 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ACADLP28330 430 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SHMT2P34897 504 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 STAT5AP42229 794 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 GNG11P61952 73 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TUBB4BP68371 445 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MC1RQ01726 317 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TUBB2AQ13885 445 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MAP7Q14244 749 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 KCNJ11Q14654 390 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 GPR19Q15760 415 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TBR1Q16650 682 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 BORAQ6PGQ7 559 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 UNC5AQ6ZN44 842 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 OTOAQ7RTW8 1153 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF605Q86T29 641 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CARFQ8N187 725 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 D2HGDHQ8N465 521 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 OR5K2Q8NHB8 316 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ACTRT1Q8TDG2 376 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 STARD8Q92502 1023 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CPT1BQ92523 772 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MED8Q96G25 268 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SLC45A3Q96JT2 553 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CATSPER2Q96P56 530 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 FCRL4Q96PJ5 515 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 NRTNQ99748 197 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TUBB2BQ9BVA1 445 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 KIFC1Q9BW19 673 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SLC12A9Q9BXP2 914 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TREX1Q9NSU2 369 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 IRAK4Q9NWZ3 460 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SEMA5BQ9P283 1151 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CROTQ9UKG9 612 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 POMT2Q9UKY4 750 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PLAGL1Q9UM63 463 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SNX12Q9UMY4 172 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SOX13Q9UN79 622 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CRYL1Q9Y2S2 319 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CTAGE9A4FU28 777 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 E5RI56 91 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SCRG1O75711 98 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TIAF1O95411 115 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 FAM87AP0C7U9 286 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SFTPCP11686 197 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MLNP12872 115 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PVRP15151 417 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ST6GAL1P15907 406 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TCP1P17987 556 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CHRM3P20309 590 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 FMO4P31512 558 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CCR10P46092 362 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 FNTAP49354 379 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
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