RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 CYTH2Q99418 400 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 NUDT22Q9BRQ3 303 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 WWP1Q9H0M0 922 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 SEMA6CQ9H3T2 930 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 MVB12BQ9H7P6 319 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 POPDC3Q9HBV1 291 aa9.64□□□□□ -0.87
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GGA3-209ENST00000580646 TAS2R13Q9NYV9 303 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
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GGA3-209ENST00000580646 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
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GGA3-209ENST00000580646 PISDQ9UG56 409 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 FETUBQ9UGM5 382 aa9.63□□□□□ -0.87
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GGA3-209ENST00000580646 IGSF10Q6WRI0 2623 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 NVLO15381 856 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 RIPK2O43353 540 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 KDM1AO60341 852 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 MATN4O95460 622 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 ACSL3O95573 720 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 RPN2P04844 631 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 FAM153BP0C7A2 387 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 MPC1LP0DKB6 136 aa9.62□□□□□ -0.87
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GGA3-209ENST00000580646 ITIH1P19827 911 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 PDHA2P29803 388 aa9.62□□□□□ -0.87
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GGA3-209ENST00000580646 PREPP48147 710 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 LIMK2P53671 638 aa9.62□□□□□ -0.87
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GGA3-209ENST00000580646 POU4F1Q01851 419 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 CFHR1Q03591 330 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 C16orf72Q14CZ0 275 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 FAM153CQ494X1 144 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 HECTD2Q5U5R9 776 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 EMBQ6PCB8 327 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 CCDC91Q7Z6B0 441 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 TBC1D21Q8IYX1 336 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 ACVR1CQ8NER5 493 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 OR5K2Q8NHB8 316 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
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