RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579815.1

CLTC-211, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 5

Gene CLTC, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-211ENST00000579815 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 LPGAT1Q92604 370 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 KCNJ9Q92806 393 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 SPDL1Q96EA4 605 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 SGF29Q96ES7 293 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 LRGUKQ96M69 825 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 CDRT15Q96T59 188 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 CD244Q9BZW8 370 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 TRIM15Q9C019 465 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 IPPKQ9H8X2 491 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 RAB26Q9ULW5 256 aa6.22□□□□□ -1.41
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CLTC-211ENST00000579815 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 DTNAQ9Y4J8 743 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 ARL5AQ9Y689 179 aa6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CLTC-211ENST00000579815 LTBP2Q14767 1821 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 NEMP2A6NFY4 417 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TMEM233B4DJY2 109 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 H3BMM5 538 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ACOT8O14734 319 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 MRASO14807 208 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TRIM24O15164 1050 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 COCHO43405 550 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 NRP2O60462 931 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ZMPSTE24O75844 475 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ABLIM3O94929 683 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 CHEK2O96017 543 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SLC4A1P02730 911 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SOD2P04179 222 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 LYNP07948 512 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 GFAPP14136 432 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PKMP14618 531 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 IDO1P14902 403 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 LBPP18428 481 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PEX2P28328 305 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PTGER3P43115 390 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 KCNQ1P51787 676 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PKNOX1P55347 436 aa6.21□□□□□ -1.42
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CLTC-211ENST00000579815 GPR85P60893 370 aa6.21□□□□□ -1.42
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CLTC-211ENST00000579815 BNIP2Q12982 314 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 CEACAM7Q14002 265 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 IHHQ14623 411 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 GPNMBQ14956 572 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 CRY1Q16526 586 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 UGT3A2Q3SY77 523 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 AGKQ53H12 422 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 FAM209AQ5JX71 171 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TMEM198Q66K66 360 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ANKS6Q68DC2 871 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PIM3Q86V86 326 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 MIER2Q8N344 545 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SPATA6LQ8N4H0 392 aa6.21□□□□□ -1.42
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CLTC-211ENST00000579815 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 DCAF4L2Q8NA75 395 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 OR7D4Q8NG98 312 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TWIST2Q8WVJ9 160 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PTERQ96BW5 349 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 RMDN1Q96DB5 314 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PHF21BQ96EK2 531 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 CENPKQ9BS16 269 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 C8orf4Q9NR00 106 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 GID8Q9NWU2 228 aa6.21□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PLK2Q9NYY3 685 aa6.21□□□□□ -1.42
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