RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	UGT1A4	P22310	534 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	ELK4	P28324	431 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	UGT1A3	P35503	534 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	UGT1A5	P35504	534 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGEF7	Q14155	803 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	CHRNA6	Q15825	494 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL35	Q6PF15	583 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	GPR149	Q86SP6	731 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	EID3	Q8N140	333 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	NUDT8	Q8WV74	236 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	IGSF21	Q96ID5	467 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	RMND5A	Q9H871	391 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	AGAP14	A8MT82	685 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	SEC14L2	O76054	403 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	IGSF6	O95976	241 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	PRPS2	P11908	318 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	CRHBP	P24387	322 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	GABARAPL2	P60520	117 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	PPP2R2B	Q00005	443 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	SGO1	Q5FBB7	561 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	PHF12	Q96QT6	1004 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	LYSMD1	Q96S90	227 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	KCNH6	Q9H252	994 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	SLC32A1	Q9H598	525 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	PARVB	Q9HBI1	364 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	C3orf18	Q9UK00	162 aa		18.01	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	BCKDHA	P12694	445 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	CCNA2	P20248	432 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINA4	P29622	427 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	SHMT2	P34897	504 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	CA5A	P35218	305 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	ENTPD1	P49961	510 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	CLDN8	P56748	225 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	RFX4	Q33E94	735 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZNB5	142 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	TET1	Q8NFU7	2136 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	RAET1E	Q8TD07	263 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	NCLN	Q969V3	563 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	FANCE	Q9HB96	536 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		18	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559		A0A096LPI6	279 aa		17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	CREG1	O75629	220 aa		17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	PRKD3	O94806	890 aa		17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	GSTM2	P28161	218 aa		17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	MAPK1	P28482	360 aa		17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	GGT5	P36269	586 aa		17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	RAB15	P59190	212 aa		17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	TMED1	Q13445	227 aa		17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	BORCS5	Q969J3	196 aa		17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	ITCH	Q96J02	903 aa		17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		17.99	■□□□□ 0.47
RRN3-205	ENST00000563559	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		17.99	■□□□□ 0.47

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