RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562425.1

PKD1-226, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 3

Gene PKD1, Length 608 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-226ENST00000562425 HAUS5O94927 633 aa15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 CCL4P13236 92 aa15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 ITIH1P19827 911 aa15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 RAB15P59190 212 aa15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 UGT3A1Q6NUS8 523 aa15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 CYB5D1Q6P9G0 228 aa15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 FAM92BQ6ZTR7 304 aa15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 GALNT7Q86SF2 657 aa15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 VRK3Q8IV63 474 aa15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 ZNF248Q8NDW4 579 aa15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 CFAP61Q8NHU2 1237 aa15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 MAGEC3Q8TD91 643 aa15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 USP7Q93009 1102 aa15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 SAYSD1Q9NPB0 183 aa15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 SLC39A1Q9NY26 324 aa15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 ZFATQ9P243 1243 aa15.94■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 TLCD2A6NGC4 264 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 VPS26AO75436 327 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 CD82P27701 267 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 SLC5A2P31639 672 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 CCNFP41002 786 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 ARL4DP49703 201 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 SEPHS1P49903 392 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 MPP1Q00013 466 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 SLC7A5Q01650 507 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 MC2RQ01718 297 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 MGAT5Q09328 741 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 DCAF12Q5T6F0 453 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 CNSTQ6PJW8 725 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 KMT5CQ86Y97 462 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 RAB42Q8N4Z0 105 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 KLHL6Q8WZ60 621 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 INPP5DQ92835 1189 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 RAD51AP1Q96B01 352 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 FAM136AQ96C01 138 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 DDA1Q9BW61 102 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 PRORYQ9H606 182 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 FBXO8Q9NRD0 319 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 FAM114A2Q9NRY5 505 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 OCIAD1Q9NX40 245 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 OR6C2Q9NZP2 312 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 SEMA5BQ9P283 1151 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 CFAP46Q8IYW2 2715 aa15.93■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 GSAPA4D1B5 854 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 C2orf74A8MZ97 194 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 MAP3K7O43318 606 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 AHSGP02765 367 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 GSTA2P09210 222 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 CBSLP0DN79 551 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 CBSP35520 551 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 ETV5P41161 510 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 CLCN7P51798 805 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 GUCY2DQ02846 1103 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 GBX1Q14549 363 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 ZNF549Q6P9A3 640 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 CEP128Q6ZU80 1094 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 NEK10Q6ZWH5 1172 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 FBXO25Q8TCJ0 367 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 ZPBPQ9BS86 351 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 FAM129AQ9BZQ8 928 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 XKR8Q9H6D3 395 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 PLAC1Q9HBJ0 212 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 TAS2R13Q9NYV9 303 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 MOCS1Q9NZB8 636 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 ACSL6Q9UKU0 697 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 DHRS7Q9Y394 339 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 KIF26BQ2KJY2 2108 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 MGAQ8IWI9 3026 aa15.92■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 PIPSLA2A3N6 862 aa15.91■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 BTN3A3O00478 584 aa15.91■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 PRAMEF10O60809 474 aa15.91■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 NELFEP18615 380 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 CDH3P22223 829 aa15.91■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 RAB28P51157 221 aa15.91■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 KYNUQ16719 465 aa15.91■□□□□ 0.14
PKD1-226ENST00000562425 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms