RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560834.1

CTDSPL2-210, Transcript of CTD small phosphatase like 2, humanhuman

TSL 4

Gene CTDSPL2, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2-210ENST00000560834 MYF5P13349 255 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SLC2A4P14672 509 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 CD1DP15813 335 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 TYK2P29597 1187 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SLC19A1P41440 591 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 HALP42357 657 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 GRK6P43250 576 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 FASLGP48023 281 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 RGS4P49798 205 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 LIMK1P53667 647 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 IL2P60568 153 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SLC14A1Q13336 389 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SP140Q13342 867 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 CSHL1Q14406 222 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 GRB7Q14451 532 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 KIR2DS5Q14953 304 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 NR1D2Q14995 579 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 INAVAQ3KP66 663 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 TECRLQ5HYJ1 363 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 STPG1Q5TH74 334 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 IYDQ6PHW0 289 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SBSNQ6UWP8 590 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 RAPH1Q70E73 1250 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 HDXQ7Z353 690 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 NAXDQ8IW45 347 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 CNPY4Q8N129 248 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 EID2Q8N6I1 236 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 OR5AR1Q8NGP9 310 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 OR5K2Q8NHB8 316 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 MAPK15Q8TD08 544 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 DLG3Q92796 817 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 COL26A1Q96A83 441 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 PTERQ96BW5 349 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 APOLD1Q96LR9 279 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 GPR78Q96P69 363 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 HGH1Q9BTY7 390 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 MENTQ9BUN1 341 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 DERL2Q9GZP9 239 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 VPS11Q9H270 941 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 POT1Q9NUX5 634 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 MKS1Q9NXB0 559 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 OR5K4A6NMS3 321 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 C4orf47A7E2U8 309 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 GFYI3L273 518 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 GOLGA8RI6L899 631 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 CDC7O00311 574 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 BTN3A1O00481 513 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 PPM1DO15297 605 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SIAH2O43255 324 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ZBTB14O43829 449 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SH3BP5O60239 455 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ICMTO60725 284 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 KLHL2O95198 593 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 C1orf105O95561 183 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 C8GP07360 202 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 TPBGLP0DKB5 382 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ERGP11308 486 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 CREB1P16220 341 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 KRT15P19012 456 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 TFEBP19484 476 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SLC26A3P40879 764 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 HHEXQ03014 270 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SLC18A2Q05940 514 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ABRQ12979 859 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 OR4D1Q15615 310 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 PHKG1Q16816 387 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 LGSNQ5TDP6 509 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 GUSBP11Q6P575 273 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 CCDC91Q7Z6B0 441 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 PIP4P1Q86T03 277 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms