RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556867.1

TDP1-216, Transcript of tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TDP1, Length 748 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1-216ENST00000556867 APMAPQ9HDC9 416 aa22.18■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa22.18■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 COMMD10Q9Y6G5 202 aa22.18■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 GSAPA4D1B5 854 aa22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 E5RI56 91 aa22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 STMND1H3BQB6 276 aa22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 URI1O94763 535 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 TUBB4AP04350 444 aa22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 CHRM3P20309 590 aa22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 SH3BP2P78314 561 aa22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 BROXQ5VW32 411 aa22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 ZNF549Q6P9A3 640 aa22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 ZBTB2Q8N680 514 aa22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 KCNJ9Q92806 393 aa22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 CFAP36Q96G28 342 aa22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 CTRCQ99895 268 aa22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 CCDC68Q9H2F9 335 aa22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 OR6C2Q9NZP2 312 aa22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 KLHL42Q9P2K6 505 aa22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 MED16Q9Y2X0 877 aa22.17■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 C2orf74A8MZ97 194 aa22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 CLCN7P51798 805 aa22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 UCNP55089 124 aa22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 FOXM1Q08050 763 aa22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 IL11RAQ14626 422 aa22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 CNSTQ6PJW8 725 aa22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 KIAA0408Q6ZU52 694 aa22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 CFAP61Q8NHU2 1237 aa22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 FAM136AQ96C01 138 aa22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 OR6C1Q96RD1 312 aa22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 PITPNM3Q9BZ71 974 aa22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 RAB17Q9H0T7 212 aa22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 C1GALT1Q9NS00 363 aa22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 ACTR10Q9NZ32 417 aa22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 GALPQ9UBC7 116 aa22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 CHD6Q8TD26 2715 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 FAM208BQ5VWN6 2430 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 HAUS5O94927 633 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 CDH3P22223 829 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 PKLRP30613 574 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 HSD11B2P80365 405 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 TGIF1Q15583 401 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 KYNUQ16719 465 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 GALNT7Q86SF2 657 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 D2HGDHQ8N465 521 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 PPM1MQ96MI6 270 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 MENTQ9BUN1 341 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 SPRY4Q9C004 299 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 PLAGL1Q9UM63 463 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 BTRCQ9Y297 605 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 NFS1Q9Y697 457 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa22.15■■□□□ 1.14
TDP1-216ENST00000556867 PIPSLA2A3N6 862 aa22.14■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 FGF5P12034 268 aa22.14■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 ARL4DP49703 201 aa22.14■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 RAB28P51157 221 aa22.14■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 GRB7Q14451 532 aa22.14■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 TTLL9Q3SXZ7 439 aa22.14■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 ANKMY2Q8IV38 441 aa22.14■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.14■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 GIMAP7Q8NHV1 300 aa22.14■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 ZNF592Q92610 1267 aa22.14■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 FOPNLQ96NB1 174 aa22.14■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 LHX6Q9UPM6 363 aa22.14■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 MATN4O95460 622 aa22.13■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 C1orf105O95561 183 aa22.13■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 EBLN1P0CF75 366 aa22.13■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 FOLR1P15328 257 aa22.13■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 GABRB3P28472 473 aa22.13■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 CCNFP41002 786 aa22.13■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 CARSP49589 748 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 TMPRSS3P57727 454 aa22.13■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 ACY1Q03154 408 aa22.13■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 TUBB3Q13509 450 aa22.13■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 KCNAB1Q14722 419 aa22.13■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 ACSBG2Q5FVE4 666 aa22.13■■□□□ 1.13
TDP1-216ENST00000556867 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa22.13■■□□□ 1.13
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