RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	DPH5	Q9H2P9	285 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SOX13	Q9UN79	622 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	CCDC78	A2IDD5	438 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	DPM1	O60762	260 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	DNAJC6	O75061	913 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	CEACAM4	O75871	244 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ASMTL	O95671	621 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	C9	P02748	559 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	FGF5	P12034	268 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	PTPN4	P29074	926 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	KRTAP10-9	P60411	292 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	TMPRSS15	P98073	1019 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	CALCOCO2	Q13137	446 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	CBLB	Q13191	982 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	PEX6	Q13608	980 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	TRADD	Q15628	312 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	SLC34A3	Q8N130	599 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	LURAP1	Q96LR2	239 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	VPS35	Q96QK1	796 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	TREX1	Q9NSU2	369 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	SMOX	Q9NWM0	555 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	MED13L	Q71F56	2210 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	MAGEB16	A2A368	324 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	AGAP14	A8MT82	685 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	CCL22	O00626	93 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	UGT1A9	O60656	530 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	PRAMEF1	O95521	474 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	UGT1A6	P19224	532 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	UGT1A1	P22309	533 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	UGT1A4	P22310	534 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	NMBR	P28336	390 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	GUCY2D	Q02846	1103 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ITGA9	Q13797	1035 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	HIF1A	Q16665	826 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	MSS51	Q4VC12	460 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	PDIK1L	Q8N165	341 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ZNF398	Q8TD17	642 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	GLYATL1	Q969I3	302 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	HDAC10	Q969S8	669 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	PWWP2A	Q96N64	755 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	GPR39	O43194	453 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	MC4R	P32245	332 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ARL4C	P56559	192 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	FOXL2	P58012	376 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	CAV1	Q03135	178 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	GPS2	Q13227	327 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	KYNU	Q16719	465 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	CASC4	Q6P4E1	433 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	THAP4	Q8WY91	577 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	LRRC39	Q96DD0	335 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	MFSD3	Q96ES6	412 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	SGSM3	Q96HU1	749 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	CHST8	Q9H2A9	424 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CS-231	ENST00000552222	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26

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