RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-229	ENST00000551936	CCNG2	Q16589	344 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	TTC1	Q99614	292 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	NLN	Q9BYT8	704 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	PAK5	Q9P286	719 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936		E7EQ34	232 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	MAP3K7	O43318	606 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	ZNF749	O43361	778 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	HCRTR1	O43613	425 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	GPC4	O75487	556 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CYP2A7	P20853	494 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CHAF1B	Q13112	559 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	SYTL3	Q4VX76	610 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CPZ	Q66K79	652 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	TRIM73	Q86UV7	250 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	VRK3	Q8IV63	474 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	TEX19	Q8NA77	164 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	PEX13	Q92968	403 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	TCTN2	Q96GX1	697 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CARD6	Q9BX69	1037 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	TCFL5	Q9UL49	500 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CDYL	Q9Y232	598 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	RELN	P78509	3460 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	MED13	Q9UHV7	2174 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936		A0A0J9YY10	115 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	ARGFX	A6NJG6	315 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	IQCF5	A8MTL0	148 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	APRT	P07741	180 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	HBQ1	P09105	142 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CCL11	P51671	97 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	PRAME	P78395	509 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	PCID2	Q5JVF3	399 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	HOOK3	Q86VS8	718 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CCDC89	Q8N998	374 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	ING2	Q9H160	280 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	SNX7	Q9UNH6	387 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	SPTA1	P02549	2419 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	ISM1	B1AKI9	464 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936		F8W8V4	182 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CTSB	P07858	339 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CBSL	P0DN79	551 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CBS	P35520	551 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	PTGIR	P43119	386 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	GRB7	Q14451	532 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	KYNU	Q16719	465 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	C4orf22	Q6V702	233 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	GPR135	Q8IZ08	494 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	ZBTB2	Q8N680	514 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	MIB2	Q96AX9	1013 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	MENT	Q9BUN1	341 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	ACSS2	Q9NR19	701 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	TREX1	Q9NSU2	369 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-229	ENST00000551936	SEC16A	O15027	2179 aa		13.96	□□□□□ -0.17

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms