RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 RPE65Q16518 533 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 ATG16L1Q676U5 607 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 ZYG11AQ6WRX3 759 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 NRROSQ86YC3 692 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 SFRP1Q8N474 314 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 FBXO39Q8N4B4 442 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 SUMF1Q8NBK3 374 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PDPRQ8NCN5 879 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 OR9A1PQ8NGU1 263 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 MAPK15Q8TD08 544 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 DENND1AQ8TEH3 1009 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 DYDC1Q8WWB3 177 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 FBXL8Q96CD0 374 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 FAM111AQ96PZ2 611 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 ATOH8Q96SQ7 321 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 EGFL8Q99944 293 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 TRMOQ9BU70 441 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PCBD2Q9H0N5 130 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 EPB41L1Q9H4G0 881 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PRDM8Q9NQV8 689 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 OXSMQ9NWU1 459 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 FAM53CQ9NYF3 392 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 CD274Q9NZQ7 290 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 NCDNQ9UBB6 729 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 COPG2Q9UBF2 871 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 XPR1Q9UBH6 696 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 TBC1D29Q9UFV1 150 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 KLF15Q9UIH9 416 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PCM1Q15154 2024 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 SUPT3HB4E1H0 165 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 TARM1B6A8C7 271 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PROB1E7EW31 1015 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 MATN2O00339 956 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 YY2O15391 372 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 SUPT3HO75486 399 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 BPGMP07738 259 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 DHRS4L1P0CG22 281 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 IMPDH1P20839 514 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 AK4P27144 223 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 SHMT2P34897 504 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 GGT5P36269 586 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 ETV4P43268 484 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 FASLGP48023 281 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 SERPINB4P48594 390 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 RAB28P51157 221 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 IRX4P78413 519 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 OR4D1Q15615 310 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 CSRP2Q16527 193 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PPP1R3AQ16821 1122 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 LIPMQ5VYY2 423 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 ANKS6Q68DC2 871 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 VRK3Q8IV63 474 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 NUDCD3Q8IVD9 361 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 ARL10Q8N8L6 244 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 FAM181AQ8N9Y4 354 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PRSS33Q8NF86 280 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 SAP25Q8TEE9 199 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 SLC22A18Q96BI1 424 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PTERQ96BW5 349 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 RMDN2Q96LZ7 410 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 MIPEPQ99797 713 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 SLC40A1Q9NP59 571 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 OR6C2Q9NZP2 312 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 CPNE7Q9UBL6 633 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PSMD13Q9UNM6 376 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PDE10AQ9Y233 779 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 ARHGEF33A8MVX0 844 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 FOXO6A8MYZ6 492 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 TMEM114B3SHH9 223 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 G3V2L1 256 aa9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms