RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540904.1

SNHG1-215, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 5

Gene SNHG1, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-215ENST00000540904 CIDEBQ9UHD4 219 aa8.96□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 PLAGL1Q9UM63 463 aa8.96□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 ICKQ9UPZ9 632 aa8.96□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 PIPSLA2A3N6 862 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 C2orf74A8MZ97 194 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 E7ESA3 106 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 MATN2O00339 956 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 KDM1AO60341 852 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 KRT37O76014 449 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 TPBGLP0DKB5 382 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 NELFEP18615 380 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 CDH3P22223 829 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 CD82P27701 267 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 ABCG1P45844 678 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 CARSP49589 748 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 CLCN7P51798 805 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 PLTPP55058 493 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 TLE3Q04726 772 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 KCNAB1Q14722 419 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 TGIF1Q15583 401 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 TRADDQ15628 312 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 TTLL9Q3SXZ7 439 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 ACSBG2Q5FVE4 666 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 STEAP4Q687X5 459 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 TTC23LQ6PF05 361 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 UNC5DQ6UXZ4 953 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 MNS1Q8NEH6 495 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 KIF18AQ8NI77 898 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 PYROXD1Q8WU10 500 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 KLHL6Q8WZ60 621 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 KCNJ9Q92806 393 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 RNF31Q96EP0 1072 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 ELMO2Q96JJ3 720 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 SLC41A2Q96JW4 573 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 FOPNLQ96NB1 174 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 OR6C1Q96RD1 312 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 NDNQ99608 321 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 SLC30A3Q99726 388 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 LRRC1Q9BTT6 524 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 DPH1Q9BZG8 443 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 B3GNT4Q9C0J1 378 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 FBXO8Q9NRD0 319 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 SOHLH2Q9NX45 425 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 ACTR10Q9NZ32 417 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 SEMA5BQ9P283 1151 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 POMT2Q9UKY4 750 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 MRFAP1Q9Y605 127 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 NFS1Q9Y697 457 aa8.95□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 ESYT3A0FGR9 886 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 STMND1H3BQB6 276 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 VPS26AO75436 327 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 C1orf105O95561 183 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 AHSGP02765 367 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 EBLN1P0CF75 366 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 LIPCP11150 499 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 FOLR1P15328 257 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 GABRB3P28472 473 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 ATP5DP30049 168 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 PKLRP30613 574 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 BDKRB1P46663 353 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 RAB28P51157 221 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 HSD11B2P80365 405 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 CAV1Q03135 178 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 MGAT5Q09328 741 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 CLN3Q13286 438 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 CUL1Q13616 776 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 TUBB2AQ13885 445 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 GBX1Q14549 363 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 IL11RAQ14626 422 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 KLHL38Q2WGJ6 581 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 BROXQ5VW32 411 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 CEACAM20Q6UY09 585 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 KIAA0408Q6ZU52 694 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 CCDC25Q86WR0 208 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 KMT5CQ86Y97 462 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 CNTN4Q8IWV2 1026 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 PALM2Q8IXS6 379 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.94□□□□□ -0.98
SNHG1-215ENST00000540904 FBXO25Q8TCJ0 367 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms