RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 ACTR10Q9NZ32 417 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 LAMA5O15230 3695 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 BTN3A1O00481 513 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 ARL4CP56559 192 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 TGIF1Q15583 401 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 UGT3A1Q6NUS8 523 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 KRT222Q8N1A0 295 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 BIRC8Q96P09 236 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 PITPNM3Q9BZ71 974 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 FAM117AQ9C073 453 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 APMAPQ9HDC9 416 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 FGF21Q9NSA1 209 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 SLC39A10Q9ULF5 831 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 CDYLQ9Y232 598 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 CRYL1Q9Y2S2 319 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 FAM208BQ5VWN6 2430 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 FAM187AA6NFU0 413 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 IQCF5A8MTL0 148 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 GOLGA8KD6RF30 607 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 GOLGA8TH3BQL2 631 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 EFSO43281 561 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 SPAG6O75602 509 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 PPP1CAP62136 330 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 SH3BP2P78314 561 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 KYNUQ16719 465 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 SPESP1Q6UW49 350 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 UNC5AQ6ZN44 842 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 KIAA0408Q6ZU52 694 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 KCNMB4Q86W47 210 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 KCNJ9Q92806 393 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 SPRY4Q9C004 299 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 FAM114A2Q9NRY5 505 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 ICKQ9UPZ9 632 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 EFCAB8A8MWE9 144 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 BTN3A3O00478 584 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 DLGAP3O95886 979 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 S1PR4O95977 384 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 TUBB4AP04350 444 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 ITGB2P05107 769 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 ABRQ12979 859 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 CRYMQ14894 314 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 NAA25Q14CX7 972 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 HIF1AQ16665 826 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 CTSL3PQ5NE16 218 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 MICALCLQ6ZW33 695 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 NEK10Q6ZWH5 1172 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 CENPUQ71F23 418 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 ZBTB2Q8N680 514 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 CFAP61Q8NHU2 1237 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 PMEPA1Q969W9 287 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 TCTN2Q96GX1 697 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 SERTAD3Q9UJW9 196 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 KCND3Q9UK17 655 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 ZNF839A8K0R7 811 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 TTI1O43156 1089 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 EBLN1P0CF75 366 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 IVDP26440 423 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 CALCOCO2Q13137 446 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 SLC5A12Q1EHB4 618 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 BBS9Q3SYG4 887 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 NAPRTQ6XQN6 538 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 SEC14L1Q92503 715 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 CATSPER2Q96P56 530 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 KRT12Q99456 494 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 FBXO5Q9UKT4 447 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 PADI1Q9ULC6 663 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 RASGRF2O14827 1237 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 KIAA0754O94854 1291 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 HBQ1P09105 142 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 CBSLP0DN79 551 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 FOLR1P15328 257 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 CBSP35520 551 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 HSD17B2P37059 387 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 GALNT7Q86SF2 657 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 SPATA4Q8NEY3 305 aa23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms