RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530120.5

CSRP1-213, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 4

Gene CSRP1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-213	ENST00000530120	KCNAB1	Q14722	419 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	LLGL1	Q15334	1064 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	P3H1	Q32P28	736 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	DET1	Q7L5Y6	550 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	KRT35	Q92764	455 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	APC	P25054	2843 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	KCNN4	O15554	427 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	SGTA	O43765	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	AP2A2	O94973	939 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	HBQ1	P09105	142 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	CDH3	P22223	829 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	ACRV1	P26436	265 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	LAMB3	Q13751	1172 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC6A19	Q695T7	634 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	LCN9	Q8WX39	176 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	RUBCNL	Q9H714	662 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	COG4	Q9H9E3	785 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	SNX12	Q9UMY4	172 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	RCCD1	A6NED2	376 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	C2orf74	A8MZ97	194 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120		F8W8V4	182 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	KDM1A	O60341	852 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	SASH3	O75995	380 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	CYP2A7	P20853	494 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	CA5A	P35218	305 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	GPR19	Q15760	415 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	IQCK	Q8N0W5	287 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120		Q8NA96	180 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	MR1	Q95460	341 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	IP6K3	Q96PC2	410 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	NLN	Q9BYT8	704 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	RNF14	Q9UBS8	474 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	SNX7	Q9UNH6	387 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	GSAP	A4D1B5	854 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120		C9J4A7	227 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	MEN1	O00255	615 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	PSMD3	O43242	534 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	LDB2	O43679	373 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	KLHL41	O60662	606 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	CD63	P08962	238 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	MC4R	P32245	332 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	RORA	P35398	523 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	NSG1	P42857	185 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	PREP	P48147	710 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	RRAD	P55042	308 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	VSNL1	P62760	191 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	CACNG1	Q06432	222 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	ITIH4	Q14624	930 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	PARP6	Q2NL67	630 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	KCTD11	Q693B1	232 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CSRP1-213	ENST00000530120	PACS1	Q6VY07	963 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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