RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529524.1

PSMA1-208, Transcript of proteasome subunit alpha 1, human

TSL 3

Gene PSMA1, Length 743 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA1-208	ENST00000529524	DIP2A	Q14689	1571 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524		A8MZ25	164 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	TPPP	O94811	219 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	CLPTM1	O96005	669 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	LIF	P15018	202 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC8A3	P57103	927 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	KRT33B	Q14525	404 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524		Q75L30	129 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	OR2A14	Q96R47	310 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	DNAJC18	Q9H819	358 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	PNMA2	Q9UL42	364 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	YIPF1	Q9Y548	306 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PSMA1-208	ENST00000529524	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		3.59	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		3.59	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	TRPM2	O94759	1503 aa		3.59	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		3.59	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		3.59	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	LRRC72	A6NJI9	287 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	PLPP2	O43688	288 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	GH2	P01242	217 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	HRH2	P25021	359 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	PON1	P27169	355 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	ACADL	P28330	430 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC6A12	P48065	614 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	UBE2V1	Q13404	147 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	KCNC3	Q14003	757 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	PTOV1	Q86YD1	416 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF614	Q8N883	585 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	EVI5L	Q96CN4	794 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	DDO	Q99489	341 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	FBXL17	Q9UF56	701 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	DISP2	A7MBM2	1401 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	CEP162	Q5TB80	1403 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	ADGRB3	O60242	1522 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	ADGRB2	O60241	1585 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	CACNA1F	O60840	1977 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	PRR32	B1ATL7	298 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524		B4DLN1	442 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524		J3QR06	171 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	PIK3C2B	O00750	1634 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	VILL	O15195	856 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC22A2	O15244	555 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	TSPAN9	O75954	239 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	NGF	P01138	241 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	PRELP	P51888	382 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	SP3	Q02447	781 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	PPARD	Q03181	441 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	XKR6	Q5GH73	641 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	ISCA2	Q86U28	154 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	SEMA4D	Q92854	862 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	GIMAP5	Q96F15	307 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	SYT15	Q9BQS2	421 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	KIF15	Q9NS87	1388 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	FSD2	A1L4K1	749 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PSMA1-208	ENST00000529524	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		3.56	□□□□□ -1.84

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