RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 SFRP1Q8N474 314 aa22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 PKP4Q99569 1192 aa22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 CPNE7Q9UBL6 633 aa22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 BTBD3Q9Y2F9 522 aa22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR91A4D1P6 747 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 TARM1B6A8C7 271 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 KERAO60938 352 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 CATP04040 527 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 CNPY4Q8N129 248 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 EID2Q8N6I1 236 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 OR5K2Q8NHB8 316 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 PHF21BQ96EK2 531 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 RBP1P09455 135 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 NR1D1P20393 614 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNA4P22459 653 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 GRB7Q14451 532 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 UNC5DQ6UXZ4 953 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 PRR23CQ6ZRP0 262 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM48Q8IWZ4 208 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 PPFIBP2Q8ND30 876 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 ARL15Q9NXU5 204 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 CD274Q9NZQ7 290 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 OARD1Q9Y530 152 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC14BA6NHZ5 514 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 G3V2L1 256 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 GDF9O60383 454 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 TGM1P22735 817 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 ETV4P43268 484 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR4P57081 412 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP2R2AP63151 447 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 PFKFB4Q16877 469 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC35F3Q8IY50 421 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 ARL14Q8N4G2 192 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 RHEBL1Q8TAI7 183 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 MCOLN3Q8TDD5 553 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 DENND1AQ8TEH3 1009 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 EGFL8Q99944 293 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCF3Q9NUQ8 709 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 SIGLEC6O43699 453 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 DFNA5O60443 496 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 DLX3O60479 287 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 VIPP01282 170 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP2A7P20853 494 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 AGTR2P50052 363 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 CAMK1GQ96NX5 476 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 EDEM2Q9BV94 578 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNH6Q9H252 994 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 ASB1Q9Y576 335 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 CASC3O15234 703 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 PPM1DO15297 605 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC16A8O95907 504 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 OAS2P29728 719 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 SP140Q13342 867 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR18Q14330 331 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 TAX1BP1Q86VP1 789 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 LCA5Q86VQ0 697 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 TBC1D21Q8IYX1 336 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 OR52E1Q8NGJ3 308 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 MAPK15Q8TD08 544 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 ATG10Q9H0Y0 220 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC16A5O15375 505 aa22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 GFAPP14136 432 aa22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 HIST1H2ADP20671 130 aa22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 HHEXQ03014 270 aa22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC153Q494R4 210 aa22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 C10orf107Q8IVU9 208 aa22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 HIST1H2AJQ99878 128 aa22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 H2AFJQ9BTM1 129 aa22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 NLGN3Q9NZ94 848 aa22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A0G2JNG1 304 aa22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 KIR2DS3K7RE56 304 aa22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 CPA3P15088 417 aa22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 CHN1P15882 459 aa22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 GDF5P43026 501 aa22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 GYS2P54840 703 aa22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 NHLH1Q02575 133 aa22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1-208ENST00000524325 KIR2DS5Q14953 304 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms