RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516032.1

RNU6-1334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1334P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZCCHC18P0CG32 403 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CPA3P15088 417 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CD1BP29016 333 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SLC8A1P32418 973 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HTR2BP41595 481 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PRCPP42785 496 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RAP1GAPP47736 663 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RGS7P49802 495 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IRX4P78413 519 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SLC25A3Q00325 362 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DMWDQ09019 674 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GAGE13Q4V321 117 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TIGD5Q53EQ6 642 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RABL3Q5HYI8 236 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C6orf141Q5SZD1 244 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 EFCAB12Q6NXP0 572 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DEGS2Q6QHC5 323 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C6orf89Q6UWU4 347 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PLEKHH3Q7Z736 793 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TPRA1Q86W33 373 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 UBQLNLQ8IYU4 475 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C1orf87Q8N0U7 546 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MINDY2Q8NBR6 621 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RDM1Q8NG50 284 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 OR14K1Q8NGZ2 314 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 WDR20Q8TBZ3 569 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TRPC4APQ8TEL6 797 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KAT2BQ92831 832 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SPDL1Q96EA4 605 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C4orf36Q96KX1 117 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C7orf34Q96L11 122 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HARBI1Q96MB7 349 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GPR78Q96P69 363 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 BTBD9Q96Q07 612 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LMF1Q96S06 567 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PNKPQ96T60 521 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GPHA2Q96T91 129 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 COQ7Q99807 217 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 BPIFA3Q9BQP9 254 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ALG12Q9BV10 488 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NUP58Q9BVL2 599 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TSPYL1Q9H0U9 437 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PIGMQ9H3S5 423 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TBC1D17Q9HA65 648 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RDH8Q9NYR8 311 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CHMP5Q9NZZ3 219 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HSFX1Q9UBD0 423 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ICKQ9UPZ9 632 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CLIC4Q9Y696 253 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GAKO14976 1311 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TRAV6A0A075B6T7 132 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FAM90A10PA6NDY2 464 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DUXAA6NLW8 204 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 BECN2A8MW95 431 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GH2P01242 217 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CEBPBP17676 345 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MATN1P21941 496 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ANXA13P27216 316 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 EPHB2P29323 1055 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LIPAP38571 399 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FNTAP49354 379 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 JAK3P52333 1124 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 VAV2P52735 878 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CHN2P52757 468 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 BLVRAP53004 296 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ADAM8P78325 824 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 XIAPP98170 497 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CNTN2Q02246 1040 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PRKCQQ04759 706 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ARHGAP1Q07960 439 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PDIA5Q14554 519 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 STXBP2Q15833 593 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CSRP2Q16527 193 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SOWAHAQ2M3V2 549 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RABGAP1LQ5R372 815 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DBX2Q6ZNG2 339 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NRARPQ7Z6K4 114 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms