RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLA2G4FQ68DD2 849 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 CORO6Q6QEF8 472 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 USP43Q70EL4 1123 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 BHLHA9Q7RTU4 235 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMPRSS11BQ86T26 416 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF554Q86TJ5 538 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 IQCHQ86VS3 1027 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM114A1Q8IWE2 563 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 NPEPL1Q8NDH3 523 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRRC8CQ8TDW0 803 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 HDAC11Q96DB2 347 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYADMQ96S97 322 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 FEVQ99581 238 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 SEPHS2Q99611 448 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 EPYCQ99645 322 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKRD2Q9GZV1 360 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 TBC1D17Q9HA65 648 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 Q9N2K0 584 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYNNQ9NPC7 610 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 TCF19Q9Y242 345 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 PADI2Q9Y2J8 665 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1W2PN81 502 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM72CH0Y354 149 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCDH7O60245 1069 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 INHBAP08476 426 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR52Z1P0C646 297 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 GNAZP19086 355 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 ACHEP22303 614 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHRNA7P36544 502 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 ASCL1P50553 236 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 B3GALT5-AS1P59052 145 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM72AQ5TYM5 149 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM72DQ6L9T8 149 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHST3Q7LGC8 479 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC186Q7Z3E2 898 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM72BQ86X60 149 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 TTC30BQ8N4P2 665 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 STPG4Q8N801 248 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR1J1Q8NGS3 322 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 SSMEM1Q8WWF3 244 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 TM9SF4Q92544 642 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 RMDN1Q96DB5 314 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 RADILQ96JH8 1075 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 SFXN2Q96NB2 322 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 FNBP1Q96RU3 617 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 PSD2Q9BQI7 771 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 RHNO1Q9BSD3 238 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC25A23Q9BV35 468 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 NUP85Q9BW27 656 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 LAT2Q9GZY6 243 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 A4GALTQ9NPC4 353 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADPRHL2Q9NX46 363 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 STK26Q9P289 416 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC24A2Q9UI40 661 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIM17Q9Y577 477 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 PMS2P5A8MQ11 134 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 MEIS2O14770 477 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATP6V0E1O15342 81 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLCO2B1O94956 709 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 GGPS1O95749 300 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 CAVIN2O95810 425 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 AMBPP02760 352 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC175P0C221 793 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMIM18P0DKX4 95 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 CA4P22748 312 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 HOXC8P31273 242 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDH11P55287 796 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 TUBB4BP68371 445 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 ACSM1Q08AH1 577 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 DMPKQ09013 629 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 ITGA7Q13683 1181 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 CA9Q16790 459 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms