RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507692.5

SNHG4-205, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 5

Gene SNHG4, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-205	ENST00000507692	CDH3	P22223	829 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ITPKB	P27987	946 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SHMT2	P34897	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SLC1A2	P43004	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ARL4D	P49703	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SEPHS1	P49903	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	UCN	P55089	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TMPRSS3	P57727	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PPP1CA	P62136	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	FOXM1	Q08050	763 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ABR	Q12979	859 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CTBP1	Q13363	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	IL11RA	Q14626	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CRYM	Q14894	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MSS51	Q4VC12	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CARF	Q8N187	725 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	BMPER	Q8N8U9	685 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CERS2	Q96G23	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	OR6C1	Q96RD1	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MAP3K3	Q99759	626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ERP44	Q9BS26	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	RAB17	Q9H0T7	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	WDR70	Q9NW82	654 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	WHRN	Q9P202	907 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	POMT2	Q9UKY4	750 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ICK	Q9UPZ9	632 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CDYL	Q9Y232	598 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	DNAJC13	O75165	2243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PIPSL	A2A3N6	862 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692		E7ESA3	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	BTN3A3	O00478	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	VPS26A	O75436	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ATP5D	P30049	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CCNF	P41002	786 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ELK3	P41970	407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ATP1A2	P50993	1020 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	RAB28	P51157	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CLCN7	P51798	805 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CXADR	P78310	365 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SH3BP2	P78314	561 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	HSD11B2	P80365	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MPP1	Q00013	466 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CAV1	Q03135	178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ACY1	Q03154	408 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TLE3	Q04726	772 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CLN3	Q13286	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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