RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CDC23	Q9UJX2	597 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ASF1A	Q9Y294	204 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SEC16A	O15027	2179 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325		B4E171	279 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	BTN3A3	O00478	584 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	RASSF9	O75901	435 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLCO2B1	O94956	709 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	APOA4	P06727	396 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ERVK-10	P10266	1014 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TSPAN7	P41732	249 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MPP1	Q00013	466 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MC2R	Q01718	297 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ABR	Q12979	859 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLN3	Q13286	438 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	KLHL35	Q6PF15	583 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	KCNMB4	Q86W47	210 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	OOSP2	Q86WS3	158 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	LCN9	Q8WX39	176 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF592	Q92610	1267 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CFAP36	Q96G28	342 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CTRC	Q99895	268 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	APMAP	Q9HDC9	416 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	STARD5	Q9NSY2	213 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ICK	Q9UPZ9	632 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SMAP	O00193	183 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	BTN3A1	O00481	513 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PFDN6	O15212	129 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SUV39H1	O43463	412 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	HAUS5	O94927	633 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ESR1	P03372	595 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	NTRK1	P04629	796 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ARL4C	P56559	192 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SH3BP2	P78314	561 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TGIF1	Q15583	401 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	HIF1A	Q16665	826 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANKS6	Q68DC2	871 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	DUPD1	Q68J44	220 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CNST	Q6PJW8	725 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	EXTL1	Q92935	676 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC30A3	Q99726	388 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	NFS1	Q9Y697	457 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TTC4	O95801	387 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CHRM3	P20309	590 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMED2	Q15363	201 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRADD	Q15628	312 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	CALML6	Q8TD86	181 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	RNF31	Q96EP0	1072 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PRKCZ-222	ENST00000496325	NAT9	Q9BTE0	207 aa		15.36	■□□□□ 0.05

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