RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	GTF2H2	Q13888	395 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	CADM2	Q8N3J6	435 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM203	Q969S6	136 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	NTN4	Q9HB63	628 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	TREX1	Q9NSU2	369 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC182	A6NF36	153 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	CTDSP2	O14595	271 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	SCEL	O95171	688 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	STS	P08842	583 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	INHBB	P09529	407 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	ODC1	P11926	461 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	GGT1	P19440	569 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	SCNN1A	P37088	669 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	GNPDA1	P46926	289 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	IL18R1	Q13478	541 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM187B	Q17R55	369 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF544	Q6NX49	715 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	ITPA	Q9BY32	194 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	C1orf109	Q9NX04	203 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	PRELID1	Q9Y255	219 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A1W2PQ72	361 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	PIR	O00625	290 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	B3GALT4	O96024	378 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	EPHA2	P29317	976 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	IFNA8	P32881	189 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	SOAT1	P35610	550 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	CASP3	P42574	277 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	PSMD8	P48556	350 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	PRIM2	P49643	509 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	AIF1	P55008	147 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	SEMA3A	Q14563	771 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	PYDC2	Q56P42	97 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	LINGO4	Q6UY18	593 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	BEND5	Q7L4P6	421 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	METTL4	Q8N3J2	472 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	OR2T29	Q8NH02	315 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	KIAA1191	Q96A73	305 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	PYCR2	Q96C36	320 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF599	Q96NL3	588 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	PHOX2B	Q99453	314 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	MMP28	Q9H239	520 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292		H3BN98	237 aa		9.62	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	IRAK2	O43187	625 aa		9.62	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	MATN4	O95460	622 aa		9.62	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		9.62	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		9.62	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	HCAR3	P49019	387 aa		9.62	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	ARHGAP1	Q07960	439 aa		9.62	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	CTF1	Q16619	201 aa		9.62	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		9.62	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		9.62	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	GPR65	Q8IYL9	337 aa		9.62	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC34A3	Q8N130	599 aa		9.62	□□□□□ -0.87
ERCC3-208	ENST00000491292	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		9.62	□□□□□ -0.87

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