RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 CCDC126Q96EE4 140 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CAMK1GQ96NX5 476 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 GPR78Q96P69 363 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H2AJQ99878 128 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 H2AFJQ9BTM1 129 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PARVBQ9HBI1 364 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TM7SF3Q9NS93 570 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 IGSF5Q9NSI5 407 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TAAR2Q9P1P5 351 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 KLF15Q9UIH9 416 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 KCNK6Q9Y257 313 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PLLPQ9Y342 182 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 BPTFQ12830 3046 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 FAM221BA6H8Z2 402 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 A6NCN8 305 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ZNF839A8K0R7 811 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PDZK1P1A8MUH7 402 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA8RI6L899 631 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 BTN3A1O00481 513 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SCAMP1O15126 338 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PCDHGA12O60330 932 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 KERAO60938 352 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TPBGLP0DKB5 382 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PDHA2P29803 388 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PREPP48147 710 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 HNMTP50135 292 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PRKAA2P54646 552 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ASPHQ12797 758 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 HLA-BQ31612 363 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 INAVAQ3KP66 663 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 KCTD16Q68DU8 428 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 IYDQ6PHW0 289 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 OGFOD3Q6PK18 319 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 LAYNQ6UX15 382 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 XKR5Q6UX68 686 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ISCA2Q86U28 154 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SLC9B2Q86UD5 537 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TCAIMQ8N3R3 496 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 RAB42Q8N4Z0 105 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 OR6C4Q8NGE1 309 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 LMX1AQ8TE12 382 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ATL1Q8WXF7 558 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 RAD51AP1Q96B01 352 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SH3KBP1Q96B97 665 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 WWP1Q9H0M0 922 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 GAREM1Q9H706 876 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 KCNK9Q9NPC2 374 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 POT1Q9NUX5 634 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 NLGN3Q9NZ94 848 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 RNF112Q9ULX5 631 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 OARD1Q9Y530 152 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ACACAQ13085 2346 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SH3BP5O60239 455 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PLIN3O60664 434 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SMIM24O75264 130 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 C1orf105O95561 183 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 S100BP04271 92 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CD59P13987 128 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 AK4P27144 223 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PPP2R2AP63151 447 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 IRF9Q00978 393 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 DLG1Q12959 904 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ABRQ12979 859 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SLC14A1Q13336 389 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 KRT33BQ14525 404 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ARHGAP19Q14CB8 494 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ZNF542PQ5EBM4 170 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TECRLQ5HYJ1 363 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SLC30A9Q6PML9 568 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 FRA10AC1Q70Z53 315 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 GPSM1Q86YR5 675 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 VRK3Q8IV63 474 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SLC22A9Q8IVM8 553 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 HOMEZQ8IX15 550 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms