RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 RDH14Q9HBH5 336 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 TMBIM4Q9HC24 238 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 MKS1Q9NXB0 559 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 KCNK4Q9NYG8 393 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 NUDT4Q9NZJ9 180 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 OR6C2Q9NZP2 312 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 LRIT1Q9P2V4 623 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 OARD1Q9Y530 152 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 NFS1Q9Y697 457 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 DOCK9Q9BZ29 2069 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 CPED1A4D0V7 1026 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 C4orf47A7E2U8 309 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 C2orf74A8MZ97 194 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 SUPT3HB4E1H0 165 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 GFYI3L273 518 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 GOLGA8RI6L899 631 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 MAP2K7O14733 419 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 TNFSF14O43557 240 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 SIGLEC6O43699 453 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 KERAO60938 352 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 KATNA1O75449 491 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 SUPT3HO75486 399 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 RFPL1O75677 317 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 C1orf105O95561 183 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 CKMT1AP12532 417 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 CD1DP15813 335 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 ACADLP28330 430 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 GCAP28676 217 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 MAGEA12P43365 314 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 RAB28P51157 221 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 PRKAA2P54646 552 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF460Q14592 562 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 CLCA4Q14CN2 919 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 STPG1Q5TH74 334 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 NAPRTQ6XQN6 538 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM26Q6ZUK4 368 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 AMIGO1Q86WK6 493 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 PLXDC1Q8IUK5 500 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM42Q8IWZ5 723 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 SYTL1Q8IYJ3 562 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 NAGSQ8N159 534 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 ARL14Q8N4G2 192 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 PNPLA1Q8N8W4 532 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 GPR156Q8NFN8 814 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 OR9A1PQ8NGU1 263 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 SLC37A2Q8TED4 501 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 PPP4R1Q8TF05 950 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 NAT14Q8WUY8 206 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 KCTD4Q8WVF5 259 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 NXNL1Q96CM4 212 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 ZDHHC12Q96GR4 267 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 APOLD1Q96LR9 279 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 MIPEPQ99797 713 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 HGH1Q9BTY7 390 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 ALG9Q9H6U8 611 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 IL21RQ9HBE5 538 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 SLC40A1Q9NP59 571 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 CDYLQ9Y232 598 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 STK38LQ9Y2H1 464 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 A6NCN8 305 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 LILRA5A6NI73 299 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 H3BQF6 201 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 UBXN7O94888 489 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 MYL2P10916 166 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 HRH2P25021 359 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 ALDH4A1P30038 563 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 SLC19A1P41440 591 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 PI4KAP42356 2102 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 GLRBP48167 497 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-210ENST00000486889 SLC18A2Q05940 514 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms