RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NFKB2Q00653 900 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MXD1Q05195 221 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLAIN1Q8ND83 568 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PKP2Q99959 881 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EXD2Q9NVH0 621 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GALNT8Q9NY28 637 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAJB4Q9UDY4 337 aa16.29■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM234BA2RU67 622 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GMFGO60234 142 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H6PDO95479 791 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTPN2P17706 415 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP1R14AQ96A00 147 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GULP1Q9UBP9 304 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OPN1SWP03999 348 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LAMP2P13473 410 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC11A1P49279 550 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UFM1P61960 85 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 B3GNT9Q6UX72 402 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM129CQ86XR2 697 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BORCS5Q969J3 196 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM63Q969Q1 353 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PHF12Q96QT6 1004 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KERAO60938 352 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR5F1O95221 314 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAPGP40121 348 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAB1Q15750 504 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PNPLA1Q8N8W4 532 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASB9Q96DX5 294 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DUSP26Q9BV47 211 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SIRPGQ9P1W8 387 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARPC2O15144 300 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLOD3O60568 738 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFS2O75306 463 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TULP3O75386 442 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RASGRP1O95267 797 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IVDP26440 423 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GSK3BP49841 420 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DGKEP52429 567 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPGNQ6UW88 154 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT74Q7RTS7 529 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTLL2Q9BWV7 592 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MUC13Q9H3R2 512 aa16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FADS2P1A8MWK0 482 aa16.27■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MATN2O00339 956 aa16.27■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRKD3O94806 890 aa16.27■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP1R3AQ16821 1122 aa16.27■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARSIQ5FYB1 569 aa16.27■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CILP2Q8IUL8 1156 aa16.27■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VIPP01282 170 aa16.27■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APODP05090 189 aa16.27■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEC13P55735 322 aa16.27■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa16.27■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF846Q147U1 533 aa16.27■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HKDC1Q2TB90 917 aa16.27■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNASE1L2Q92874 299 aa16.27■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LMLNQ96KR4 655 aa16.27■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLX4Q8IY92 1834 aa16.27■□□□□ 0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LDB2O43679 373 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C8GP07360 202 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAP2AP10114 183 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NT5EP21589 574 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RCVRNP35243 200 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MERTKQ12866 999 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANO7Q6IWH7 933 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GALNT13Q8IUC8 556 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CGREF1Q99674 301 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BRWD1Q9NSI6 2320 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DIRAS1O95057 198 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAPSNQ13702 412 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFAF6Q330K2 333 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C2orf27AQ580R0 203 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCST1Q5T197 706 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR4F3Q6IEY1 312 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AGMOQ6ZNB7 445 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HID1Q8IV36 788 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF570Q96NI8 536 aa16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H3BNX3 289 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLIC3O95833 236 aa16.26■□□□□ 0.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms